新年好！介绍两个植物环状RNA数据库

今天是新年的第一天，恭祝各位新年快乐，身体健康，工作顺利，一切顺心。

虽然这篇文章发表了已经有几个月了，但是看到即有缘，那就拿来一起看看吧~

环状RNA（circRNA）是一种新型的内源性非编码RNA，具有共价闭合的环状结构，在各种组织中广泛表达，在细胞过程中具有功能意义。作为竞争性内源性RNAs（ceRNAs），circRNAs是miRNA活性的重要调控者。这些circRNA的鉴定突出了ncRNA介导的调节网络的日益复杂性。

然而，需要更多的生物学证据来推断直接的circRNA-miRNA相关性，而与哺乳动物中的大量研究相比，植物中的circRNAs却很少受到关注。

PlantCircNet作为一个综合数据库提供，在八个模型植物中提供含有鉴定的circRNA的可视化植物circRNA-miRNA-mRNA调控网络。 来自多个来源的数据的生物信息学整合揭示了circRNA-miRNA-mRNA调节网络，并有助于鉴定出circRNA的代谢效应的潜在机制。实施富集分析工具以检测显着过表达的miRNA靶基因本体类别。还研究了circRNA的基因组注释，序列和同种型。

PlantCircNet提供用户友好的界面，用于查询特定植物circRNA的详细信息。该数据库可以作为促进植物circRNA研究的资源。鉴定了几种circRNA在花发育中起潜在的调节作用，并分别响应来自与miR156a和AT5G59720相关的调控网络的环境胁迫。 目前的研究表明，circRNA可能参与不同的生物过程。

黑暗大邪神陛下点评：这篇文章其实就是作者开发了一个数据库，有关于植物环状RNA，提供了检索、预测、比对、可视化等功能。

我们应该随时把玩把玩我们自己的研究内容，可以把我们研究的一些基因，拿到这个数据库里去比比看，说不定能够看到有一些circRNA和我们基因有关，那可能又是一个新的层次了。

此外，去年浙大农学院樊龙江组也在《Molecular Plant》发表了研究论文，开发了一个类似的植物环状RNA数据库，有兴趣的也可以上那把玩把玩自己的基因哦。

附上两个数据库的网站链接：

http://bis.zju.edu.cn/plantcircnet/index.php

希望今年可以多出成果，多发文章，关键还是要身体健康！

"植物病毒与抗逆研究"由浙江省农业科学院--浙江大学植物病理学博士研究生黑暗大邪神管理与运营。

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