独家 | 面部识别技术能用来识别鲸鱼？ Kaggle露脊鲸识别大赛NO.1教你实现！

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本文为你分享《露脊鲸识别大赛》冠军的竞赛经验。

《露脊鲸识别大赛》是由NOAA渔场和Kaggle数据科学平台组织的计算机视觉竞赛。deepsense.io的机器学习团队在竞赛中获得了第一名。本文翻译自他们的经验分享帖。

比赛官网：https://www.kaggle.com/c/noaa-right-whale-recognition/details/

原文地址：https://deepsense.io/deep-learning-right-whale-recognition-kaggle/

比赛目标

本次竞赛的目标是在航拍的照片中识别单个露脊鲸。露脊鲸长达18米，重达91吨。数据集中含有447头不同的露脊鲸（基本上是现存露脊鲸的所有数量了）。虽然这个数字对于一个物种来说太少了，但是识别鲸鱼对人来说还是一个巨大的挑战。识别过程的自动化（至少部分自动化）对拯救露脊鲸是非常有益的。

研究者正致力于解救被渔具意外捕获的鲸鱼，而实时识别鲸鱼能够让研究者获得相关健康和渔网缠绕的历史记录，有助于研究者拯救鲸鱼。——摘录竞赛的描述页。

这些航拍的照片是在不同时间，使用不同设备拍摄的，质量参差不齐：有的非常清晰，鲸鱼正好居中；有的拍摄距离很远，聚焦很差。

鲸鱼图片示例

竞赛要求参赛团队建立一个模型，以识别照片中捕获的鲸鱼是447只鲸鱼中的哪一只。说的更专业一点，对于每张照片，我们需要提供所有447只鲸鱼的概率分布。模型的优劣通过多类对数损失（交叉熵）来评估。

值得注意的是，训练数据集并不平衡。不同鲸鱼之间的照片数量差别很大：有一些“名鲸”有40张左右，大多数有十几张，还有二十多只鲸鱼只有一张照片。另一个挑战是不同类别的图像（即不同的鲸鱼）彼此非常相似。这与我们区分狗、猫、袋熊和飞机的情况有些不同。这对我们训练的神经网络造成了一些困难：区别不同的鲸鱼的特征只占了图像的一小部分，并不是很明显。帮助我们的分类器专注于正确的特征，即鲸鱼的头部和皮肤斑纹（callosity pattern），被证明是至关重要的。

算法构架

卷积神经网络（CNN）已经被证明在图像识别领域中表现非常出色，所以我们自然而然地采用CNN作为基础。事实上，据我们所知，几乎所有顶级选手都在使用它们。即使有些人说CNN需要大量的数据（我们只有4,544个训练数据图像可用，一些鲸鱼在整个训练集中只出现一次），但我们还是能够训练出一个不错的模型，这证明即使是有限的数据，CNN也是一个强大的工具。

我们的算法包括以下几个步骤：

• 头部定位器（使用CNN）
• 头部校准器（使用CNN）
• ·在鲸鱼护照照片（经处理的标准照）上训练多个CNN网络
• ·做平均，调整预测（不用CNN）

算法的一个技巧是为网络提供一些额外的目标，即使这些额外的目标不一定在后期使用。如果附加目标依赖于我们特别感兴趣的部分图像（即在这种情况下的头部和皮肤斑纹），这个技巧将强制网络集中在该区域上。此外，网络有更多的刺激进行学习，因此必须开发更鲁棒的特征来限制过拟合。

软硬件

我们使用Python，Numpy和Theano来实现我们的算法。为了创建人工标注（并且保证在长时间里不失去理智），我们使用了Sloth（一个通用的标签工具）以及一个专用的Julia脚本。

为了训练我们的模型，我们使用了两种Nvidia的显卡：Tesla K80和GRID K520。

相关领域知识

尽管人类识别鲸鱼似乎比其他人更难，但神经网络不会因为明显的原因而遭受这种问题。即使这样，维基百科对鲸鱼的研究显示，“露脊鲸最大的特征是由于鲸鱼虱寄生而导致的头皮上的白色，粗糙的皮肤”，这不仅是露脊鲸区别于其他种类鲸鱼的特征，也是区别不同露脊鲸的特征。我们的算法也主要用了这个特征。除了这个微不足道的提示（由组织者提供）告诉我们应该关注什么，我们对露脊鲸并没有其他知识。

准备工作

在进一步了解细节之前，我们需要一个免责声明。在比赛中，人们会（或应该）倾向于测试新的方法，而不是微调和清理现有的方法。因此，在一个idea被证明工作得很好之后不久，我们通常就放下它。这样的一个副作用就是，算法的某些过于复杂，有缺陷的部分可能（并且应该）被解决，但我们在比赛中并没有着手解决。本文中也不会涉及这些问题。

人们不需要从数据集中看许多图像，以便意识到鲸鱼的姿势不是非常好（或者在这种特定情况下至少不愿意这样做）。

不太配合的鲸鱼

因此，在训练最终分类器之前，我们花了一些时间（和精力）来解释这个事实。这种方法的可以理解为从随机的图片中（被摄对象处于任意位置）获取护照照片（标准照片）。这也是头部定位器和头部校准器的目的。头部定位器对输入的照片中的头部产生一个边框，但此时头部还处于一个随机的方向，而且不一定在照片中间。头部校准器将前面圈出的头部区域进行旋转和缩放，使得喷水孔（blowhead）和帽尖（bonnet-tip）总是处于固定的位置，距离也不变。这两个步骤都是通过在人工标注的训练集上训练神经网络完成的。

帽尖（红点）和喷水孔（蓝点）

鲸鱼定位

这是为了获得优质的护照照片而迈出的第一步。 为了获得训练数据，我们在训练数据中手动标注了所有的鲸鱼，并用方框圈出了它们的头部（特别感谢我们的人力资源部门帮助！）。

头部定位器得到的头部边框

这些标注为训练集中的每个图像提供四个数字：矩形的左下角和右上角的坐标。然后我们训练一个收到原始图像（调整为256×256）的CNN并输出边界框的两个坐标。虽然这显然是一个回归的任务，但我们并未使用L2损失函数，而是将输出量化分组并使用Softmax以及交叉熵损失函数，并取得了更大的成功。我们还尝试了几种不同的方法，包括训练CNN来区分头部照片和非头部照片，甚至是一些非监督方法。然而，他们的结果却逊色不少。

此外，头部定位网络还必须预测喷水孔和帽尖的坐标（以相同的量化方式），但是在这个任务中不太成功，所以我们忽略了这个输出。

我们训练了5个不同的网络，架构基本相同。

头部定位器的构架

这5个网络不同之处在于用于量化坐标的buckets的数量。我们尝试了20，40，60，128，还有另外一个较小的网络用了20个buckets。

在将图像输入网络之前，我们进行了数据增强（调整到256 x 256以后）。

• 旋转：最大到10度（注意，如果使用更大的角度，就不能仅仅旋转这些点，你必须重新计算边界，我们太懒没有这么做）
• 缩放：1/1.2到1.2之间的随机比率
• 颜色扰动，比例为0.01。

虽然我们没有采用测试时增强技术，但我们将所有5个网络的输出相结合，即每次裁剪后的图片传到下一步（头部校准）时，我们会在5个网络的输出结果中随机选择一个。如上所述，这些网络的裁剪结果非常令人满意。实际上，我们并没有真正“物理地”裁剪图像（即产生一堆更小的图像），我们所做的（事实证明也是非常方便的）只是生成一个含有边框信息的json文件。这可能是无关紧要的，但是这样让我们能够轻松进行试验。

鲸鱼的“护照照片”

分类器的最后一步就是调整照片，使他们都符合相同的标准。基本的想法是训练一个CNN来估计喷水孔和帽尖的坐标。有了这些坐标，就可以很容易构造变换，使得原始图像变换为这两个点总是处于相同的位置（即头部校准）。由于Anil Thomas的标注，我们有了训练集的坐标。所以，我们再次训练CNN来预测量化坐标。虽然使用整个图像来确定这些点也是可能的（即跳过头部定位的步骤），但通过前面的操作我们可以更容易得实现头部校准。

另外，网络还有一些额外的任务要解决。首先，它需要预测哪只鲸鱼在图像上（即解决原始任务），此外还需要知道鲸鱼头部的皮肤斑纹是否连续（又一次需要在人工标注的训练集进行训练，虽然这时工作量少多了，每个鲸鱼2-3张图片就够了）。

不连续（左）和连续（右）的皮肤斑纹

我们使用如下的架构。

头部校准器的构架

从头部定位器中我们获得了头部的大概位置，来作为头部校准器的输入。这次我们敢于使用更大胆的数据增强：

• 平移，随机平移，最大4个像素
• 旋转，最大360度
• 缩放，1到1.5之间的随机比率
• 颜色扰动，比例为0.01

此外，我们使用了测试时的数据增强技术-对5次随机数据增强的结果进行平均。这个网络效果相当惊人。准确来说，在人工检查期间，几乎所有图像的喷水孔和帽尖的位置几乎都被完美地预测。此外，作为副产品，我们开始看到一些对识别鲸鱼有前景的结果。悲观的是在验证集上的损失在2.2左右。

把所有模块组装到一起

当链接多台机器学习算法时，需要相当谨慎。 如果我们在训练集上训练头部定位器和校准器，并使用它们为训练集和测试集制作“护照照片”，我们得到的照片可能会质量差异很大（可能还有一些其他属性）。 在这些裁剪的图片上训练分类器时，这可能是一个严重的困难。而在测试时，它接受的输入与其习惯的输入很不相似，导致算法无法正常工作。

虽然我们知道这一事实，但在检查裁剪结果时，我们发现训练集和测试集之间的质量没有太大差异。 此外，我们已经看到对数损失（log loss）的巨大进步。 按照“more idea, less dwelling”的思想，我们决定不再优化这个算法。

鲸鱼的“护照照片”

最终的分类器

网络架构

我们几乎所有的模型都在256×256图像上工作，使用相同的架构。所有卷积层都使用3×3的滤波器，图像大小没有变化，所有池化层均为3×3，stride为2，图像大小减半。 此外，所有卷积层之后都跟一个batch normalization和ReLU nonlinearity。

主网架构

在最终的混合模型中，我们还使用了一些具有类似架构的网络，但是在512×512图像上工作。有一个具有这种架构的“双”版本的网络（具有堆叠卷积层的独立副本，在全连接层前合并）。

再次，我们通过添加额外的目标 - 确定鲸鱼皮肤斑纹的连续性（与头对齐器情况相同），违反了网络的舒适区域（comfort zone）。 我们还尝试添加更多来自其他人工标注的目标，其中一个是“脸的对称性”。 不幸的是，它没有进一步改善结果。

数据增强

现阶段的数据增加比平常有点棘手。 原因在于，你必须在充分丰富数据集，和不破坏从上一步获得的对齐和归一化两者之间进行平衡。 我们最终使用相当温和的数据增强。 虽然所有模型中确切的参数不是固定的，但最常见的是：

• 平移：随机移动，最多4像素，
• 旋转：最大8度，
• 缩放：1.0和1.3之间的随机比率，
• 随机翻转
• 颜色扰动，比例为0.01

我们还使用了测试时的数据增强，对20多个随机增强数据进行平均。

初始化

我们使用了一个非常简单的初始化规则，零中心正态分布，卷积层的std为0.01，全连接层的std为0.001。 这已经很好了。

正则化

对于所有模型，我们仅使用L2正则化。不过卷积层和全连接层使用了单独的超参数。对于卷积层，我们使用较小的正则化，约0.0005；而对于全连接层，我们优选较高的值，通常在0.01 - 0.05左右。

前文提过，我们对网络增加额外的目标。这对权重造成了额外的限制，导致网络更多地关注鲸鱼的头部（而不是说水上的一些随机图案），这种方法很好地抑制了过拟合。

训练

基本上我们所有的模型都使用随机梯度下降（SGD）以0.9的momentum进行训练的。通常我们在约500-1000个epochs之后停下来（确切的时间并不重要，因为不会有过拟合）。在训练过程中，我们对学习率使用了相当缓慢的指数衰减（0.9955），并且还经常手动调整学习率。比如突然手动提高学习率（然后继续缓慢指数衰减），这时网络的错误（在训练集和验证集上）会先上升很多，然后在几个epoch之后，它又降到了更低水平。我们最好的模型还使用了另一个idea - 它首先用Nesterov momentum训练了超过一百个epoch，然后我们切换到Adam（自适应矩估计）。如果从一开始就使用Adam，我们无法实现类似的损失。初始学习率可能不重要，但是我们使用0.0005左右的初值。

验证

我们使用随机的10％的训练数据进行验证。多亏了我们最喜欢的7300号种子，我们所有模型都使用这个种子。虽然我们知道这种方法造成一些鲸鱼在训练集中不存在，但它已经很好了。验证集上效果相当差，并与排行榜很相关。

放弃10％的相对较小的数据集不是没有任何犹豫的决定。因此，在我们确定一个模型已经足够好之后，我们继续重新使用验证集进行训练（这很容易理解，因为我们没有任何过拟合的问题）。这是通过在整个训练集上从头开始重新运行所有计算（很少这么做），或者（更经常地）将验证集添加到训练集中并额外运行50-100个epoch完成的。这也是为了解决仅在我们的验证集中出现的单张鲸鱼照片的问题。

预测组合

最后我们得到了一系列在验证集上得分在0.97到1.3之间的模型（实际测试成绩更好）。由于保持了一致的验证集，我们能够测试一些混合技术以及基本变换。最后我们得出结论，使用更复杂的组合方法是不太合理的，因为我们的验证集不包括所有不同的鲸鱼，实际上相当小。我们并没有时间去做一些花哨的交叉验证，只做了一些简单的验证。

尽管对预测结果进行简单加权平均没有提供比最佳模型更好的分数（除非我们明显地提高了最佳模型的权重）。但是当将预测提升到中等功率（我们在最终解决方案中使用1.45）后，我们可以得到大约〜0.1的对数损失的改进。我们还没有仔细检查，但是可以假定这个技巧是有效的，因为我们全连接层被强制规范化了，并不容易产生更极端的概率。

我们还使用了一些“安全”的变换，比如对所有预测增加一个小量，以及将它们稍微偏斜到训练集中发现的鲸鱼分布。不过这些措施没怎么影响最后的分数。

加载图像

在我们算法的最后和中间阶段，我们从磁盘加载的图像是原始图像。这些文件很大，为了有效地使用gpu，我们必须并行加载它们。我们认为主要的时间开销是从磁盘加载图像，但后来发现这并非如此。相反，将JPEG文件解码为numpy数组才是最花时间的。我们做了一个快餐式的基准测试，来自数据集的111个随机原始图像总共为85Mb。当它们没有缓存在RAM中时读取他们大概需要420 ms，而读取和解码到numpy数组需要大约10秒，这是一个巨大的差别。可能的解决方案是使用其他图像格式，以提供更快的编码速度（会牺牲图像大小为代价），GPU解码等。

一些技巧

尽管如此，很难说一个技术能够超过其他一切其他技术（除非进行仔细的分析），我们这里只提供关键技巧。

获取高质量的裁剪图像，以及校准头部

我们已经通过两个阶段实现了这一点，结果远远超过了我们在一个阶段观察到的结果。

人工标注，为网络提供额外的目标

这是基于向原始图像添加附加标注。它需要人工检查数千个鲸鱼的图片，我们在各个阶段（头部定位，头部校准和分类）中都用到了这些人工的标注结果。

踢（加速）学习率

虽然这可能是一个粗心的初始化，差的学习率衰减策略，以及不够好的SGD导致的。但事实证明，踢（加速）学习率做得很好。

踢（加速）学习率后的损失函数

校正概率

将预测提升到[1.1 - 1.6]范围内的中等功率对几乎所有模型或者混合模型都有帮助。这个技巧是在比赛结束时发现的，而且将得分提高了0.1。

重用验证集

合并验证和训练集，并运行额外的50-100个epoch，我们在得分上得到了稳步的提升。

结论

总的来说，这个问题和比赛很吸引人。我们在这个过程中学到了很多东西，并且惊叹于深度学习的威力！

特别感谢Christin Khan和NOAA为数据科学界提供了这个特殊的挑战。我们希望这将激励其他人。当然，如果没有Kaggle.com（他们的平台做得很好）所有这一切都会更加困难。我们还要感谢Nvidia给我们使用Nvidia K80 GPU - 它们太棒了。

李选选，数据派研究部志愿者清华大学工程物理系博士研究生。

专业是面向计算生物学的数据分析和算法开发，对机器学习和大数据很感兴趣。

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