Circos
是绘制圈图的神器,在http://circos.ca/images/页面有很多CIRCOS可视化的示例。
Circos可以在线使用,在线使用时是把表格转为圈图,不过只允许最大75行和75列;做一些简单的示意图会比较好,最后时会介绍下在线的tableviewer
的使用。
也可以安装在本地,在本地可以绘制基于基因组的更复杂的图。
Circos由Perl写成,安装相对简单,只要Perl的包都装好了就可以了。
circos -module
cpanm YAML Clone Config::General Font::TTF::Font GD GD::Polyline List::MoreUtils Math::Bezier Math::Round Math::VecStat Params::Validate Readonly Regexp::Common SVG Set::IntSpan Statistics::Basic Text::Format
in terminal
.libgd
from http://libgd.bitbucket.org if GD
can not be installed. Make sure gdlib-config
is $PATH.