ChIP-seq基本分析流程

前年在中科院做培训时，整理了一套ChIP-seq分析流程，截选实战部分，略作修改，分享出来，希望大家指正。

那次培训内容比较杂，还有关于TCGA、ICGC、ProteinAtlas等数据库的使用, 前面已经分享过，链接如下：

• UCSC XENA - 集大成者(TCGA, ICGC)
• ICGC数据库使用
• TCGA数据库在线使用

下面步入正题，这套流程从ChIP-实验、测序注意事项、测序深度，到分析整体流程，再到每一步如序列比对，富集效率评估、热图、峰图可视化，deeptools2使用、peak calling和motif分析等。

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》于2018年4月14在北京鼓楼推出《ChIP-seq分析专题培训》，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个ChIP-seq实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创线下集中授课2天+自行练习5天+再集中讲解答疑2天三段式教学，并提供学习视频，教、学、练、答结合，真正实现独立分析大数据。