ChIP-seq基本分析流程

前年在中科院做培训时,整理了一套ChIP-seq分析流程,截选实战部分,略作修改,分享出来,希望大家指正。

那次培训内容比较杂,还有关于TCGA、ICGC、ProteinAtlas等数据库的使用, 前面已经分享过,链接如下:

下面步入正题,这套流程从ChIP-实验、测序注意事项、测序深度,到分析整体流程,再到每一步如序列比对,富集效率评估、热图、峰图可视化,deeptools2使用、peak calling和motif分析等。

在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》于2018年4月14在北京鼓楼推出《ChIP-seq分析专题培训》,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个ChIP-seq实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析,独创线下集中授课2天+自行练习5天+再集中讲解答疑2天三段式教学,并提供学习视频,教、学、练、答结合,真正实现独立分析大数据。

原文发布于微信公众号 - 生信宝典(Bio_data)

原文发表时间:2018-03-27

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