Numpy 修炼之道（11）—— 掩码数组

abs_zero

修改于 2018-05-26 14:37:18

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推荐阅读时间：8min~10min 文章内容：Numpy掩码数组（Numpy异常值、缺失值处理）

简介

有时候数据集中存在缺失、异常或者无效的数值，我们可以标记该元素为被屏蔽（无效）状态。

>>> import numpy as np
>>> import numpy.ma as ma
>>> x = np.array([1, 2, 3, -99, 5])
>>> x
array([  1,   2,   3, -99,   5])

现在可以创造一个掩码数组（标记第四个元素为无效状态）。

>>> mx = ma.masked_array(x, mask=[0, 0, 0, 1, 0])
>>> mx
masked_array(data = [1 2 3 -- 5],
 mask = [False False False True False],
 fill_value = 999999)

接下来可以计算平均值而不用考虑无效数据。

>>> mx.mean()
2.75

访问掩码

可通过其mask属性访问掩码数组的掩码。我们必须记住，掩码中的True条目表示无效数据。

>>> mx
masked_array(data = [1 2 3 -- 5],
             mask = [False False False  True False],
       fill_value = 999999)

>>> mx.mask
array([False, False, False,  True, False], dtype=bool)

只访问有效数据

当只想访问有效数据时，我们可以使用掩码的逆作为索引。可以使用numpy.logical_not函数或简单使用~运算符计算掩码的逆：

>>> x = ma.array([[1, 2], [3, 4]], mask=[[0, 1], [1, 0]])
>>> x[~x.mask]
masked_array(data = [1 4],
             mask = [False False],
       fill_value = 999999)

另一种检索有效数据的方法是使用compressed方法，该方法返回一维ndarray（或其子类之一，取决于baseclass属性）：

>>> x.compressed()
array([1, 4])

修改掩码

通过将True赋给掩码，可以立即屏蔽数组的所有数据：

>>> x = ma.array([1, 2, 3], mask=[0, 0, 1])
>>> x.mask = True
>>> x
masked_array(data = [-- -- --],
             mask = [ True  True  True],
       fill_value = 999999)

最后，可以通过向掩码分配一系列布尔值来对特定数据条目进行掩码和/或取消掩码：

>>> x = ma.array([1, 2, 3])
>>> x.mask = [0, 1, 0]
>>> x
masked_array(data = [1 -- 3],
             mask = [False  True False],
       fill_value = 999999)

取消掩码

要取消屏蔽一个或多个特定数据条目，我们只需为它们分配一个或多个新的有效值：

>>> x = ma.array([1, 2, 3], mask=[0, 0, 1])
>>> x
masked_array(data = [1 2 --],
             mask = [False False  True],
       fill_value = 999999)
>>> x[-1] = 5
>>> x
masked_array(data = [1 2 5],
             mask = [False False False],
       fill_value = 999999)

要取消屏蔽掩码数组的所有掩码条目（假设掩码不是硬掩码），最简单的解决方案是将常量nomask分配给掩码：

>>> x = ma.array([1, 2, 3], mask=[0, 0, 1])
>>> x
masked_array(data = [1 2 --],
             mask = [False False  True],
       fill_value = 999999)
>>> x.mask = ma.nomask
>>> x
masked_array(data = [1 2 3],
             mask = [False False False],
       fill_value = 999999)

索引和切片

由于MaskedArray是numpy.ndarray的子类，它会继承其用于索引和切片的机制。

当访问没有命名字段的被掩蔽数组的单个条目时，输出是标量（如果掩码的相应条目是False）或特殊值masked （如果掩码的相应条目为True）：

>>> x = ma.array([1, 2, 3], mask=[0, 0, 1])
>>> x[0]
1
>>> x[-1]
masked_array(data = --,
             mask = True,
       fill_value = 1e+20)
>>> x[-1] is ma.masked
True

如果掩蔽的数组具有命名字段，访问单个条目将返回numpy.void对象（如果没有掩码），或者如果至少一个字段具有与初始数组相同的dtype的0d掩码数组的字段被屏蔽。

>>> y = ma.masked_array([(1,2), (3, 4)],
...                mask=[(0, 0), (0, 1)],
...               dtype=[('a', int), ('b', int)])
>>> y[0]
(1, 2)
>>> y[-1]
masked_array(data = (3, --),
             mask = (False, True),
       fill_value = (999999, 999999),
            dtype = [('a', '<i4'), ('b', '<i4')])

当访问切片时，输出是掩蔽的数组，其data属性是原始数据的视图，并且其掩码是nomask（如果没有无效条目原始数组）或原始掩码的相应切片的副本。需要复制以避免将掩模的任何修改传播到原始版本。

>>> x = ma.array([1, 2, 3, 4, 5], mask=[0, 1, 0, 0, 1])
>>> mx = x[:3]
>>> mx
masked_array(data = [1 -- 3],
             mask = [False  True False],
       fill_value = 999999)
>>> mx[1] = -1
>>> mx
masked_array(data = [1 -1 3],
             mask = [False  True False],
       fill_value = 999999)
>>> x.mask
array([False,  True, False, False,  True], dtype=bool)
>>> x.data
array([ 1, -1,  3,  4,  5])

访问具有结构化数据类型的掩蔽数组的字段会返回MaskedArray。