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Science头条:你的皮肤里早已有癌症突变

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大数据文摘
发布2018-05-21 15:57:05
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发布2018-05-21 15:57:05
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文章被收录于专栏:大数据文摘大数据文摘

摘自:生物谷

微信号:BIOONNEWS

根据最近发表在Science的一篇研究分析,经常暴露于紫外线下的正常皮肤含有许多潜在的致病突变,包括至少6种癌症相关基因。英国Wellcome Trust Sanger Institute的研究人员研究了无癌的眼睑皮肤样本,发现上百个克隆细胞群穿插在整个正常组织,而重要的是,就这么小块的皮肤组织里的细胞里含有的癌症关联的突变。

为了找到体细胞突变是如何聚集在正常组织的,由Campbell和Philip Jones带领的剑桥大学医学研究中心癌症部,从暴露阳光下的眼睑真皮组织取样234个进行活检。这些样品来自四位55到73岁之间的健康人,他们在眼睑整容手术过程中去除了部分的眼睑组织。

采用能够捕获稀有突变的技术,该团队测序的74个与皮肤和其它癌症基因的外显子,以及一个活组织样品的全部基因组。研究人员选择采样皮肤细胞部分原因是有证据表明,正常皮肤中含有肿瘤抑制基因p53突变的细胞克隆。

研究人员发现每兆碱基大约有5个突变,类似于某些癌症的高突变程度。一些突变是存在于皮肤的鳞状细胞癌。74个基因中只有6个基因突变是会导致生长的优势基因。NOTCH1,其参与干细胞调节,是检测的样品中最常见的突变。含有FGFR3突变的细胞克隆一般存在于良性皮肤生长(脂溢性角化病),而在这次的检测样品占到了很大的比例。“这表明,一个基因可以产生大量的克隆和抑制该克隆演化成癌症的后续演进”Jones说。

研究人员还估计了发现的突变与相关的克隆扩增大小的关系。令人惊奇的是,这些含有驱动突变(Driver Mutations)的克隆扩增的幅度比仅携带乘客突变(Passengar Mutation)的细胞相比高了大约50%。“这意味着你需要一个生长优势才能进行到下一个突变,但这种增长的优势并不是故事的全部内容。”据London’s Institute of Cancer Research的 Mel Greaves教授评论说,有癌症驱动突变克隆出现温和增长的优势至少有两个可能的解释。“可能你需要更多的驱动突变得到一个有力的克隆,即会变成癌症”他说。“另一种解释是,拥有这些突变的细胞类型是至关重要的。”因为皮肤细胞一直在改变,只有干细胞或祖细胞是持续不变的,才能癌变。

研究结果还引起了年龄对皮肤细胞影响的关注,包括癌驱动突变为什么可能会随着年龄而堆积,甚至加快。

编者注

Science Paper

原文链接在这儿:

http://www.sciencemag.org/content/348/6237/880.abstract

Science 22 May 2015:

Vol. 348 no. 6237 pp. 880-886 DOI: 10.1126/science.aaa6806

原文标题:High burden and pervasive positive selection of somatic mutations in normal human skin

大数据文摘医疗大数据专栏

2015年2月7日“医疗大数据专栏”正式成立。随着基因芯片及DNA测序技术的发展,生物医疗大数据迅猛发展,既是大数据技术发展的原动力,也是大数据技术的受益者。大数据文摘2013年7月成立,我们专注数据,每日坚持分享优质内容,从未间断,我们努力为读者和志愿者打造一个分享和交流平台。作为大数据文摘的志愿者群,我们中有不少人从事医疗大数据相关工作,关心医疗大数据的发展,愿意通过这个专栏,和大家一起分享医疗大数据的点点滴滴。

医疗大数据专栏主编介绍

孙强,资深生物信息专家,现在服务于美国国立癌症研究所,从事癌症基因组数据库管理工作。热爱大数据,加入大数据文摘志愿者行列一年有余,愿以文会友,广结大数据善缘。旅居美国多年,现在定居于大华府地区。

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原始发表:2015-05-29,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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