前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >Jupyter Notebook的27个窍门,技巧和快捷键

Jupyter Notebook的27个窍门,技巧和快捷键

作者头像
大数据文摘
发布2018-05-25 12:36:58
5.2K0
发布2018-05-25 12:36:58
举报
文章被收录于专栏:大数据文摘大数据文摘

翻译|姜范波 校对|毛丽 & 寒小阳

Jupyther notebook ,也就是一般说的 Ipython notebook,是一个可以把代码、图像、注释、公式和作图集于一处,从而实现可读性分析的一种灵活的工具。

Jupyter延伸性很好,支持多种编程语言,可以很轻松地安装在个人电脑或者任何服务器上——只要有ssh或者http接入就可以啦。最棒的一点是,它完全免费哦。

Jupyter 界面

默认情况下,Jupyter Notebook 使用Python内核,这就是为什么它原名 IPython Notebook。Jupyter notebook是Jupyter项目的产物——Jupyter这个名字是它要服务的三种语言的缩写:Julia,PYThon和R,这个名字与“木星(jupiter)”谐音。本文将介绍27个轻松使用Jupyter的小窍门和技巧。

◆ ◆ ◆

1.快捷键

高手们都知道,快捷键可以节省很多时间。Jupyter在顶部菜单提供了一个快捷键列表:Help > Keyboard Shortcuts 。每次更新Jupyter的时候,一定要看看这个列表,因为不断地有新的快捷键加进来。另外一个方法是使用Cmd + Shift + P ( Linux 和 Windows下 Ctrl + Shift + P亦可)调出命令面板。这个对话框可以让你通过名称来运行任何命令——当你不知道某个操作的快捷键,或者那个操作没有快捷键的时候尤其有用。这个功能与苹果电脑上的Spotlight搜索很像,一旦开始使用,你会欲罢不能。

几个我的最爱:

  • Esc + F 在代码中查找、替换,忽略输出。
  • Esc + O 在cell和输出结果间切换。
  • 选择多个cell:
    • Shift + J 或 Shift + Down 选择下一个cell。
    • Shift + K 或 Shift + Up 选择上一个cell。
    • 一旦选定cell,可以批量删除/拷贝/剪切/粘贴/运行。当你需要移动notebook的一部分时这个很有用。
  • Shift + M 合并cell.

◆ ◆ ◆

2.变量的完美显示

有一点已经众所周知。把变量名称或没有定义输出结果的语句放在cell的最后一行,无需print语句,Jupyter也会显示变量值。当使用Pandas DataFrames时这一点尤其有用,因为输出结果为整齐的表格。

鲜为人知的是,你可以通过修改内核选项ast_note_interactivity,使得Jupyter对独占一行的所有变量或者语句都自动显示,这样你就可以马上看到多个语句的运行结果了。

代码语言:javascript
复制
In [1]: from IPython.core.interactiveshell import InteractiveShell        InteractiveShell.ast_node_interactivity = "all"In [2]: from pydataset import data        quakes = data('quakes')        quakes.head()        quakes.tail()Out[2]:        lat long    depth   mag stations        1   -20.42  181.62  562 4.8 41        2   -20.62  181.03  650 4.2 15        3   -26.00  184.10  42  5.4 43        4   -17.97  181.66  626 4.1 19        5   -20.42  181.96  649 4.0 11Out[2]:        lat long    depth   mag stations        996 -25.93  179.54  470 4.4 22        997 -12.28  167.06  248 4.7 35        998 -20.13  184.20  244 4.5 34        999 -17.40  187.80  40  4.5 14        1000    -21.59  170.56  165 6.0 119

如果你想在各种情形下(Notebook和Console)Jupyter都同样处理,用下面的几行简单的命令创建文件~/.ipython/profile_default/ipython_config.py即可实现:

代码语言:javascript
复制
c = get_config()# Run all nodes interactivelyc.InteractiveShell.ast_node_interactivity = "all"

◆ ◆ ◆

3.轻松链接到文档

在Help 菜单下,你可以找到常见库的在线文档链接,包括Numpy,Pandas,Scipy和Matplotlib等。

另外,在库、方法或变量的前面打上?,即可打开相关语法的帮助文档。

代码语言:javascript
复制
In [3]: ?str.replace()

代码语言:javascript
复制
        Docstring:
        S.replace(old, new[, count]) -> str

        Return a copy of S with all occurrences of substring
        old replaced by new.  If the optional argument count is
        given, only the first count occurrences are replaced.
        Type:      method_descriptor

◆ ◆ ◆

4.在notebok里作图

在notebook里作图,有多个选择:

- matplotlib (事实标准)(http://matplotlib.org/),可通过%matplotlib inline 激活,(https://www.dataquest.io/blog/matplotlib-tutorial/) - %matplotlib notebook 提供交互性操作,但可能会有点慢,因为响应是在服务器端完成的。 - mpld3(https://github.com/mpld3/mpld3) 提供matplotlib代码的替代性呈现(通过d3),虽然不完整,但很好。 - bokeh(http://bokeh.pydata.org/en/latest/) 生成可交互图像的更好选择。 - plot.ly(https://plot.ly/) 可以生成非常好的图,可惜是付费服务。

◆ ◆ ◆

5.Jupyter Magic命令

上文提到的%matplotlib inline 是Jupyter Magic命令之一。

推荐阅读Jupyter magic命令的相关文档

(http://ipython.readthedocs.io/en/stable/interactive/magics.html),它一定会对你很有帮助。下面是我最爱的几个:

◆ ◆ ◆

6.Jupyter Magic-%env:设置环境变量

不必重启jupyter服务器进程,也可以管理notebook的环境变量。有的库(比如theano)使用环境变量来控制其行为,%env是最方便的途径。

代码语言:javascript
复制
In [55]:    # Running %env without any arguments
            # lists all environment variables

            # The line below sets the environment
            # variable OMP_NUM_THREADS
            %env OMP_NUM_THREADS=4

代码语言:javascript
复制
            env: OMP_NUM_THREADS=4

◆ ◆ ◆

7.Jupyter Magic-%run:运行python代码

%run 可以运行.py格式的python代码——这是众所周知的。不那么为人知晓的事实是它也可以运行其它的jupyter notebook文件,这一点很有用。

注意:使用%run 与导入一个python模块是不同的。

代码语言:javascript
复制
In [56]:    # this will execute and show the output from
            # all code cells of the specified notebook
            %run ./two-histograms.ipynb

◆ ◆ ◆

8.Jupyter Magic-%load:从外部脚本中插入代码

该操作用外部脚本替换当前cell。可以使用你的电脑中的一个文件作为来源,也可以使用URL。

代码语言:javascript
复制
In [ ]:     # Before Running
            %load ./hello_world.py
In [61]:    # After Running
            # %load ./hello_world.py
            if __name__ == "__main__":
                print("Hello World!")

代码语言:javascript
复制
            Hello World!

◆ ◆ ◆

9.Jupyter Magic-%store:在notebook文件之间传递变量

%store 命令可以在两个notebook文件之间传递变量。

代码语言:javascript
复制
In [62]:    data = 'this is the string I want to pass to different notebook'
            %store data
            del data # This has deleted the variable

代码语言:javascript
复制
            Stored 'data' (str)

现在,在一个新的notebook文档里……

代码语言:javascript
复制
In [1]: %store -r data
        print(data)

代码语言:javascript
复制
        this is the string I want to pass to different notebook

◆ ◆ ◆

10.Jupyter Magic-%who:列出所有的全局变量

不加任何参数, %who 命令可以列出所有的全局变量。加上参数 str 将只列出字符串型的全局变量。

代码语言:javascript
复制
In [1]: one = "for the money"
        two = "for the show"
        three = "to get ready now go cat go" 
        %who str

代码语言:javascript
复制
        one  three   two    

◆ ◆ ◆

11.Jupyter Magic-计时

有两种用于计时的jupyter magic命令: %%time 和 %timeit.当你有一些很耗时的代码,想要查清楚问题出在哪时,这两个命令非常给力。

仔细体会下我的描述哦。

%%time 会告诉你cell内代码的单次运行时间信息。

代码语言:javascript
复制
In [4]: %%time
        import time
        for _ in range(1000):
            time.sleep(0.01)# sleep for 0.01 seconds

代码语言:javascript
复制
        CPU times: user 21.5 ms, sys: 14.8 ms, total: 36.3 ms
        Wall time: 11.6 s

%%timeit 使用了Python的 timeit 模块,该模块运行某语句100,000次(默认值),然后提供最快的3次的平均值作为结果。

代码语言:javascript
复制
In [3]: import numpy
        %timeit numpy.random.normal(size=100)

代码语言:javascript
复制
        The slowest run took 7.29 times longer than the fastest. This could mean that an intermediate result is being cached.
        100000 loops, best of 3: 5.5 µs per loop

◆ ◆ ◆

12.Jupyter Magic-writefile and %pycat:导出cell内容/显示外部脚本的内容

使用%%writefile magic可以保存cell的内容到外部文件。 而%pycat功能相反,把外部文件语法高亮显示(以弹出窗方式)。

代码语言:javascript
复制
In [7]: %%writefile pythoncode.py

        import numpy
        def append_if_not_exists(arr, x):
            if x not in arr:
                arr.append(x)

        def some_useless_slow_function():
            arr = list()
            for i in range(10000):
                x = numpy.random.randint(0, 10000)
                append_if_not_exists(arr, x)

代码语言:javascript
复制
        Writing pythoncode.py

代码语言:javascript
复制
In [8]: %pycat pythoncode.py

代码语言:javascript
复制
        import numpy
        def append_if_not_exists(arr, x):
            if x not in arr:
                arr.append(x)

        def some_useless_slow_function():
            arr = list()
            for i in range(10000):
                x = numpy.random.randint(0, 10000)
                append_if_not_exists(arr, x)

◆ ◆ ◆

13.Jupyter Magic-%prun:告诉你程序中每个函数消耗的时间

使用%prun+函数声明会给你一个按顺序排列的表格,显示每个内部函数的耗时情况,每次调用函数的耗时情况,以及累计耗时。

代码语言:javascript
复制
In [47]:    %prun some_useless_slow_function()

代码语言:javascript
复制
         26324 function calls in 0.556 seconds

   Ordered by: internal time

   ncalls  tottime  percall  cumtime  percall filename:lineno(function)
    10000    0.527    0.000    0.528    0.000 <ipython-input-46-b52343f1a2d5>:2(append_if_not_exists)
    10000    0.022    0.000    0.022    0.000 {method 'randint' of 'mtrand.RandomState' objects}
        1    0.006    0.006    0.556    0.556 <ipython-input-46-b52343f1a2d5>:6(some_useless_slow_function)
     6320    0.001    0.000    0.001    0.000 {method 'append' of 'list' objects}
        1    0.000    0.000    0.556    0.556 <string>:1(<module>)
        1    0.000    0.000    0.556    0.556 {built-in method exec}
        1    0.000    0.000    0.000    0.000 {method 'disable' of '_lsprof.Profiler' objects}

◆ ◆ ◆

14.Jupyter Magic-用%pdb调试程序

Jupyter 有自己的调试界面The Python Debugger (pdb)(https://docs.python.org/3.5/library/pdb.html),使得进入函数内部检查错误成为可能。

Pdb中可使用的命令见链接(https://docs.python.org/3.5/library/pdb.html#debugger-commands)

代码语言:javascript
复制
In [ ]: %pdb

        def pick_and_take():
            picked = numpy.random.randint(0, 1000)
            raise NotImplementedError()

        pick_and_take()
        Automatic pdb calling has been turned ON
        ---------------------------------------------------------------------------
        NotImplementedError                       Traceback (most recent call last)
        <ipython-input-24-0f6b26649b2e> in <module>()
              5     raise NotImplementedError()
              6 
        ----> 7 pick_and_take()

        <ipython-input-24-0f6b26649b2e> in pick_and_take()
              3 def pick_and_take():
              4     picked = numpy.random.randint(0, 1000)
        ----> 5     raise NotImplementedError()
              6 
              7 pick_and_take()

        NotImplementedError: 
        > <ipython-input-24-0f6b26649b2e>(5)pick_and_take()
              3 def pick_and_take():
              4     picked = numpy.random.randint(0, 1000)
        ----> 5     raise NotImplementedError()
              6 
              7 pick_and_take()

        ipdb> 

◆ ◆ ◆

15.末句函数不输出

有时候不让末句的函数输出结果比较方便,比如在作图的时候,此时,只需在该函数末尾加上一个分号即可。

代码语言:javascript
复制
In [4]: %matplotlib inline
        from matplotlib import pyplot as plt
        import numpy
        x = numpy.linspace(0, 1, 1000)**1.5
In [5]: # Here you get the output of the function
        plt.hist(x)
Out[5]:
        (array([ 216.,  126.,  106.,   95.,   87.,   81.,   77.,   73.,   71.,   68.]),
         array([ 0. ,  0.1,  0.2,  0.3,  0.4,  0.5,  0.6,  0.7,  0.8,  0.9,  1. ]),
         <a list of 10 Patch objects>)
代码语言:javascript
复制
In [6]: # By adding a semicolon at the end, the output is suppressed.
        plt.hist(x);

◆ ◆ ◆

16.运行Shell命令

在notebook内部运行shell命令很简单,这样你就可以看到你的工作文件夹里有哪些数据集。

代码语言:javascript
复制
In [7]: !ls *.csv

代码语言:javascript
复制
nba_2016.csv             titanic.csv
pixar_movies.csv         whitehouse_employees.csv

◆ ◆ ◆

17.用LaTex写公式

当你在一个Markdown单元格里写LaTex时,它将用MathJax呈现公式:如

$$ P(A \mid B) = \frac{P(B \mid A) , P(A)}{P(B)} $$

会变成

◆ ◆ ◆

18.在notebook内用不同的内核运行代码

如果你想要,其实可以把不同内核的代码结合到一个notebook里运行。

只需在每个单元格的起始,用Jupyter magics调用kernal的名称:

  • %%bash
  • %%HTML
  • %%python2
  • %%python3
  • %%ruby
  • %%perl In [6]: %%bash for i in {1..5} do echo "i is $i" done

代码语言:javascript
复制
            i is 1
            i is 2
            i is 3
            i is 4
            i is 5

◆ ◆ ◆

19.给Jupyter安装其他的内核

Jupyter的优良性能之一是可以运行不同语言的内核。下面以运行R内核为例说明:

简单的方法:通过Anaconda安装R内核

代码语言:javascript
复制
conda install -c r r-essentials

稍微麻烦的方法:手动安装R内核

如果你不是用Anaconda,过程会有点复杂,首先,你需要从CRAN安装R。

之后,启动R控制台,运行下面的语句:

代码语言:javascript
复制
install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools'))
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()  # to register the kernel in the current R installation

◆ ◆ ◆

20.在同一个notebook里运行R和Python

要这么做,最好的方法事安装rpy2(需要一个可以工作的R),用pip操作很简单:

pip install rpy2

然后,就可以同时使用两种语言了,甚至变量也可以在二者之间公用:

代码语言:javascript
复制
In [1]: %load_ext rpy2.ipython
In [2]: %R require(ggplot2)
Out[2]: array([1], dtype=int32)
In [3]: import pandas as pd
        df = pd.DataFrame({
                'Letter': ['a', 'a', 'a', 'b', 'b', 'b', 'c', 'c', 'c'],
                'X': [4, 3, 5, 2, 1, 7, 7, 5, 9],
                'Y': [0, 4, 3, 6, 7, 10, 11, 9, 13],
                'Z': [1, 2, 3, 1, 2, 3, 1, 2, 3]
            })
In [4]: %%R -i df
        ggplot(data = df) + geom_point(aes(x = X, y= Y, color = Letter, size = Z))

◆ ◆ ◆

21.用其他语言写函数

有时候numpy的速度有点慢,我想写一些更快的代码。

原则上,你可以在动态库里编译函数,用python来封装…

但是如果这个无聊的过程不用自己干,岂不更好?

你可以在cython或fortran里写函数,然后在python代码里直接调用。

首先,你要先安装:

代码语言:javascript
复制
!pip install cython fortran-magic 


In [ ]: %load_ext Cython
In [ ]: %%cython
        def myltiply_by_2(float x):
            return 2.0 * x
In [ ]: myltiply_by_2(23.)

我个人比较喜欢用Fortran,它在写数值计算函数时十分方便。更多的细节在(http://arogozhnikov.github.io/2015/09/08/SpeedBenchmarks.html)

代码语言:javascript
复制
In [ ]: %load_ext fortranmagic
In [ ]: %%fortran
        subroutine compute_fortran(x, y, z)
            real, intent(in) :: x(:), y(:)
            real, intent(out) :: z(size(x, 1))

            z = sin(x + y)

        end subroutine compute_fortran
In [ ]: compute_fortran([1, 2, 3], [4, 5, 6])

还有一些别的跳转系统可以加速python 代码。更多的例子见(http://arogozhnikov.github.io/2015/09/08/SpeedBenchmarks.html)

你可以在cython或fortran里写函数,然后在python代

◆ ◆ ◆

22.支持多指针

Jupyter支持多个指针同步编辑,类似Sublime Text编辑器。按下Alt键并拖拽鼠标即可实现。

◆ ◆ ◆

23.Jupyter外界拓展

Jupyter-contrib extensions(https://github.com/ipython-contrib/jupyter_contrib_nbextensions)是一些给予Jupyter更多更能的延伸程序,包括jupyter spell-checker和code-formatter之类.

下面的命令安装这些延伸程序,同时也安装一个菜单形式的配置器,可以从Jupyter的主屏幕浏览和激活延伸程序。

代码语言:javascript
复制
!pip install https://github.com/ipython-contrib/jupyter_contrib_nbextensions/tarball/master
!pip install jupyter_nbextensions_configurator
!jupyter contrib nbextension install --user
!jupyter nbextensions_configurator enable --user

◆ ◆ ◆

24.从Jupyter notebook创建演示稿

Damian Avila的RISE(https://github.com/damianavila/RISE)允许你从已有的notebook创建一个powerpoint形式的演示稿。 你可以用conda来安装RISE:

代码语言:javascript
复制
conda install -c damianavila82 rise

或者用pip安装:

代码语言:javascript
复制
pip install RISE

然后运行下面的代码来安装和激活延伸程序:

代码语言:javascript
复制
jupyter-nbextension install rise --py --sys-prefix
jupyter-nbextension enable rise --py --sys-prefix

◆ ◆ ◆

25.Jupyter输出系统

Notebook本身以HTML的形式显示,单元格输出也可以是HTML形式的,所以你可以输出任何东西:视频/音频/图像。

这个例子是浏览我所有的图片,并显示前五张图的缩略图。

代码语言:javascript
复制
In [12]:    import os
            from IPython.display import display, Image
            names = [f for f in os.listdir('../images/ml_demonstrations/') if f.endswith('.png')]
            for name in names[:5]:
                display(Image('../images/ml_demonstrations/' + name, width=100))

我们也可以用bash命令创建一个相同的列表,因为magics和bash运行函数后返回的是python 变量:

代码语言:javascript
复制
In [10]:    names = !ls ../images/ml_demonstrations/*.png
            names[:5]
Out[10]:    ['../images/ml_demonstrations/colah_embeddings.png',
             '../images/ml_demonstrations/convnetjs.png',
             '../images/ml_demonstrations/decision_tree.png',
             '../images/ml_demonstrations/decision_tree_in_course.png',
             '../images/ml_demonstrations/dream_mnist.png']

◆ ◆ ◆

26.大数据分析

很多方案可以解决查询/处理大数据的问题:

◆ ◆ ◆

27.分享notebook

分享notebook最方便的方法是使用notebook文件(.ipynb),但是对那些不使用notebook的人,你还有这些选择:

你的最爱是哪些?

在评论里告诉我哪些是你的最爱小窍门吧!

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2016-11-08,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 大数据文摘 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • ◆ ◆ ◆
  • ◆ ◆ ◆
  • ◆ ◆ ◆
  • ◆ ◆ ◆
  • ◆ ◆ ◆
  • ◆ ◆ ◆
  • ◆ ◆ ◆
  • ◆ ◆ ◆
    • 8.Jupyter Magic-%load:从外部脚本中插入代码
    • ◆ ◆ ◆
      • 9.Jupyter Magic-%store:在notebook文件之间传递变量
      • ◆ ◆ ◆
        • 10.Jupyter Magic-%who:列出所有的全局变量
        • ◆ ◆ ◆
          • 11.Jupyter Magic-计时
          • ◆ ◆ ◆
            • 12.Jupyter Magic-writefile and %pycat:导出cell内容/显示外部脚本的内容
            • ◆ ◆ ◆
              • 13.Jupyter Magic-%prun:告诉你程序中每个函数消耗的时间
              • ◆ ◆ ◆
                • 14.Jupyter Magic-用%pdb调试程序
                • ◆ ◆ ◆
                  • 15.末句函数不输出
                  • ◆ ◆ ◆
                    • 16.运行Shell命令
                    • ◆ ◆ ◆
                      • 17.用LaTex写公式
                      • ◆ ◆ ◆
                        • 18.在notebook内用不同的内核运行代码
                        • ◆ ◆ ◆
                          • 19.给Jupyter安装其他的内核
                            • 简单的方法:通过Anaconda安装R内核
                              • 稍微麻烦的方法:手动安装R内核
                              • ◆ ◆ ◆
                                • 20.在同一个notebook里运行R和Python
                                • ◆ ◆ ◆
                                  • 21.用其他语言写函数
                                  • ◆ ◆ ◆
                                    • 22.支持多指针
                                    • ◆ ◆ ◆
                                      • 23.Jupyter外界拓展
                                      • ◆ ◆ ◆
                                        • 24.从Jupyter notebook创建演示稿
                                        • ◆ ◆ ◆
                                          • 25.Jupyter输出系统
                                          • ◆ ◆ ◆
                                            • 26.大数据分析
                                            • ◆ ◆ ◆
                                              • 27.分享notebook
                                              • 你的最爱是哪些?
                                              领券
                                              问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档