3D-QSAR

软件:OPen3dQSAR(这个很重要,免费),可以实现SYBYL等软件的构效关系模型建立,命令窗口形式运行,但是有教程,跟着教程操作难度不大,如果有其它软件的基础更好。

思路:align--calc_field(Vdw,electro)--pls(loo,crossvalidate)--QSAR model

测试例子:39个,r2=0.9267,q2=0.3488

初步达到效果,如果用软件自带的离子数值会更好。

原文发布于微信公众号 - 分子生物和分子模拟计算(bio-simulation)

原文发表时间:2016-11-25

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