GPU加速分子模拟

电脑配置:X5650*2=24core,48G ecc+reg内存

显卡:nvidia C2050*4

6GB DDR5存储器 *4

fermi架构 448个cuda核心*4

单精度浮点性能 1.03Tflops*4

存储器频率 1.GHZ

功耗:238W

平台:centos7+fftw3+nvidia driver 365+cuda8

测试软件:gromacs 5.1.4,手工编译source code

测试结果:相同的体系,不用GPU加速, 1.5ns/day ;启用了GPU加速计算,11ns/day.

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6,7年前的旧卡,四个合共1792个CUDA,可以有如此的加速效果,是超出预期。GTX1080 为pascal架构,内建72亿个晶体管,拥有2560个CUDA核心 ,gtx980ti有2816个CUDA核心。所以建议大家都预算一块N卡吧。

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PS:硬件买回来了,软件平台和软件的编译都是问题,大家看着办吧。

GTX980Ti参数规格对比

显卡

GTX780Ti

GTX980

GTX980Ti

GTX TITAN X

核心代号

GK110

GM204

GM200

GM200

晶体管数

71亿

52亿

80亿

80亿

制作工艺

28纳米

28纳米

28纳米

28纳米

流处理器

2880

2048

2816

3072

纹理单元

240

128

176

192

ROPs

48

64

96

96

显存容量

3GB

4GB

6GB

12GB

显存位宽

384bit

256bit

384bit

384bit

核心频率

876-928MHz

1126-1216MHz

1000-1076MHz

1002-1076MHz

Boost幅度

5.9%

8.0%

7.6%

7.5%

显存频率

7000MHz

7012MHz

7012MHz

7012MHz

外接供电

6+8pin

6+6pin

6+8pin

6+8pin

原文发布于微信公众号 - 分子生物和分子模拟计算(bio-simulation)

原文发表时间:2016-11-05

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