GPU加速分子模拟

电脑配置：X5650*2=24core，48G ecc+reg内存

显卡：nvidia C2050*4

6GB DDR5存储器 *4

fermi架构 448个cuda核心*4

单精度浮点性能 1.03Tflops*4

存储器频率 1.GHZ

功耗：238W

平台：centos7+fftw3+nvidia driver 365+cuda8

测试软件：gromacs 5.1.4,手工编译source code

测试结果：相同的体系，不用GPU加速， 1.5ns/day ;启用了GPU加速计算，11ns/day.

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6，7年前的旧卡，四个合共1792个CUDA，可以有如此的加速效果，是超出预期。GTX1080 为pascal架构，内建72亿个晶体管，拥有2560个CUDA核心 ，gtx980ti有2816个CUDA核心。所以建议大家都预算一块N卡吧。

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PS：硬件买回来了，软件平台和软件的编译都是问题，大家看着办吧。