前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 3

高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 3

作者头像
生信宝典
发布2018-08-01 11:53:01
4060
发布2018-08-01 11:53:01
举报
文章被收录于专栏:生信宝典生信宝典

前面两篇文章(高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 1高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 2)介绍了EPGG的基本使用、各部分特征、Track类型、物种支持、公共数据、结果储存发表和分享等。这都是基本浏览器的功能。除数据浏览功能外,EPGG还提供了数据分析和绘图功能,具体如下:

EPGG还提供了很多实用的分析功能,如下图:

同时展示多个基因在多个样品的表达或修饰状态

基因组浏览器分成2个panel,对比展示区域。类似于基因集展示,但更灵活。

只展示基因区,移除基因间区,更方便浏览。

染色体范围的Track分布。

同源基因、同源区域展示,两物种共线性基因组联动。

两个数值Track在给定区域的比较,比如看启动子区H3K4me1和K3K27me3的结合,识别Bivalent promoter

TSS上下游区域H3K4me1, H3K27me3等修饰或TF结合图谱绘制

Roadmap数据专用展示。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2018-07-13,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 生信宝典 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档