全局测表达量定位到感兴趣基因或功能已经成为常规流程

不一定是转录水平的表达量。

看到一篇文章提到了这个DESI-MSI分析，可以说目前主流的研究都会引入表达芯片或者mRNA-seq测序来看敲减目标基因或者过表达基因后的效果，但是该文章探索的主要是蛋白质的表达量。

esorption electrospray ionization mass spectrometry imaging (DESI-MSI)

Using DESI-MSI, we compared tumor tissues of FABP4 siRNA group (low FABP4 expression, n = 3) to control siRNA samples (high FABP4 expression, n = 3).

有了这样的表达数据，肯定是走一波标准的差异分析流程，然后定位到上调还有下调的基因集，然后走一波GO/KEGG/RECTOME/BIOCARTA/MsigDB数据库的注释。

还有 To identify signaling pathways downstream of FABP4, we conducted reverse phase protein arrays (RPPA) after silencing FABP4 in HeyA8 MDR cells.

基因表达数据使用的是公共数据库。