Illumina测序仪比较和各种测序应用模式图,助力了解高通量测序

Illumina做为全球最大的二代测序仪生产商,成立于1998年,起家是芯片技术,2006年收购Solexa,开启了二代测序的霸主地位,占有至少七成的二代测序市场份额。今年Illumina将以大约12亿美元的价格收购Pacific Biosciences,扩大对长读长序列的访问并加速科学发现,在三代测序的积极布局也会带来新的市场突破和技术突破。华大继MGISEQ200/2000后,又推出了MGISEQ-T7,希望能在市场上争取更多的份额和应用。这部分也会更新在测序发展史:150年的风雨历程中。

不谈技术和市场,Illumina官网是学习和了解基本高通量测序技术、发展和应用的一个比较好的渠道。

  • 了解不同测序仪的性能、参数、应用和周期信息。NGS基础 - 高通量测序原理
  • 了解都有哪些测序应用,RNA层面,DNA层面,单细胞层面,近百种不同的建库测序方式,致力于解决不同层面的问题。对于扩大视野和寻找设计方案都很有帮助,每一个都是一张精美的图示。

RNA-蛋白互作的各种RIP,CLIP等。

RNA-DNA互作(lncRNA调控机制),全长RNA的检测等。

表观修饰,染色质开放性检测,染色质三维结构等。

各种单细胞水平的测序 (2019年转录组课程增加开单细胞测序的分析了)。

了解了测序的不同应用,学学基本的生信操作(Linux、R和Python)和高级的分析(转录组、扩增子和宏基因组)吧。

原文发布于微信公众号 - 生信宝典(Bio_data)

原文发表时间:2018-12-10

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