专栏首页生信宝典Illumina测序仪比较和各种测序应用模式图,助力了解高通量测序

Illumina测序仪比较和各种测序应用模式图,助力了解高通量测序

Illumina做为全球最大的二代测序仪生产商,成立于1998年,起家是芯片技术,2006年收购Solexa,开启了二代测序的霸主地位,占有至少七成的二代测序市场份额。今年Illumina将以大约12亿美元的价格收购Pacific Biosciences,扩大对长读长序列的访问并加速科学发现,在三代测序的积极布局也会带来新的市场突破和技术突破。华大继MGISEQ200/2000后,又推出了MGISEQ-T7,希望能在市场上争取更多的份额和应用。这部分也会更新在测序发展史:150年的风雨历程中。

不谈技术和市场,Illumina官网是学习和了解基本高通量测序技术、发展和应用的一个比较好的渠道。

  • 了解不同测序仪的性能、参数、应用和周期信息。NGS基础 - 高通量测序原理
  • 了解都有哪些测序应用,RNA层面,DNA层面,单细胞层面,近百种不同的建库测序方式,致力于解决不同层面的问题。对于扩大视野和寻找设计方案都很有帮助,每一个都是一张精美的图示。

RNA-蛋白互作的各种RIP,CLIP等。

RNA-DNA互作(lncRNA调控机制),全长RNA的检测等。

表观修饰,染色质开放性检测,染色质三维结构等。

各种单细胞水平的测序 (2019年转录组课程增加开单细胞测序的分析了)。

了解了测序的不同应用,学学基本的生信操作(Linux、R和Python)和高级的分析(转录组、扩增子和宏基因组)吧。

文章分享自微信公众号:
生信宝典

本文参与 腾讯云自媒体分享计划 ,欢迎热爱写作的你一起参与!

原始发表时间:2018-12-10
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
登录 后参与评论
0 条评论

相关文章

  • 华大基因及子公司测序产品在美被禁,lllumina初步胜诉

    6月13日,美国加州北部地区法院法官William Orrick批准了Illumina公司对华大基因的禁令。华大基因使用标准MPS测序和CoolMPS化学测序技...

    新智元
  • 中科院研究组新建一种高敏高精度的RNA poly(A)尾巴检测技术

    RNA poly(A)尾巴是成熟的mRNA和lncRNA的重要组成部分,对RNA稳定性和翻译起着重要的调控作用。然而目前的poly(A)尾巴检测技术仍然非常有限...

    生信宝典
  • 华农玉米团队从群体水平揭示DNA甲基化变异对表型的贡献

    近日,华中农也大学和美国明尼苏达大学合作解析了玉米自然群体中的DNA甲基化变异,揭示了DNA甲基化变异的遗传基础以及DNA甲基化变异与基因表达和表型的关联。该成...

    生信宝典
  • 外显子测序简介

    外显子测序,也叫做外显子捕获测序。首先利用序列捕获技术将外显子区域的DNA捕获并富集,然后进行高通量测序。外显子测序主用用来分析基因组上的变异位点,包括SNP和...

    生信修炼手册
  • 第二代测序原理的详细解析!

    第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR...

    SYSU星空
  • 单细胞测序系列(1)--单细胞全基因组测序

    仅2018年,他的研究团队就发表了11篇单细胞测序方向文章,获得了单细胞测序领域的接连重要成果。他众多学术成果中,有40余篇论文发表在Cell, Nature,...

    用户6317549
  • illumina测序原理

    illumina 测序最大的就是通量大,正是由于通量大,才可以做大价格低。由于其通量大且价格低,可以满足巨大部分测序的需要,因此,正式开启了高通量测...

    生信喵实验柴
  • 魔方大数据(7)| 瀚海基因董事长贺建奎:大数据存储和分析依旧是基因测序的难题

    <数据猿导读> 测序仪这个行业与大数据不一样,大数据是瞬间爆发,但做测序仪,通常是要五年才能做起来。目前在国内,测序仪并不算是主流业务,而且大量数据都只专注在基...

    数据猿
  • 个性化医疗投资笔记

    大数据文摘
  • RNA-seq数据分析指南

    五月份看了一篇2016年的RNA-Seq文献综述,那篇文献特别长,花了三四天时间才看完。当时为了做组会文献报告做了一些许总结,以ppt的形式呈现出来。 内容 前...

    生信技能树
  • 高分辨率系统发育微生物群落剖析

    摘要:在过去十年中,在微生物群落分析方面,短读长高通量16S rRNA基因扩增子测序,已经使克隆依赖性长读长Sanger测序黯然失色。过渡到新技术提供了更多的定...

    用户1075469
  • 了解测序这件事

    Thermofisher:https://www.thermofisher.com

    生信喵实验柴
  • NBT|45种单细胞轨迹推断方法比较,110个实际数据集和229个合成数据集

    轨迹推断(Trajectory Inference,TI),是分析从千上万单细胞的组学数据中推断细胞发育轨迹的重要方法,也被称为伪时序分析 (pseudotim...

    生信宝典
  • QB期刊 | 深度学习在生物学中的应用1:对MinION测序结果中base calling的计算

    记得去年“阿尔法狗”(AlphaGo)的新闻出来后,小编曾下定决心要跨专业学习一下AI,看看它能否在咱们生物领域也掀起热浪。结果当小编刚刚了解到阿...

    生信宝典
  • 使用纳米孔测序数据进行16S-DNA条形码研究的计算方法[综述]

    3.Centrifuge和Minimap2是处理纳米孔数据的最合适工具,并且可以认为它们是当前的最佳选择;

    用户1075469
  • 基因组拼接原理

    前面我们了解了基因组拼接,今天给大家带来的是拼接原理。了解实验原理,就是为了我们更好地做实验。

    生信喵实验柴
  • illumina、Sanger、第三代和第四代测序技术原理

    1953年4月,Watson和Crick关于DNA双螺旋结构的文章发表于Nature,成为生物学研究的里程碑。此后,生命科学进入了DNA解密的时代。道德经所言“...

    DoubleHelix
  • 2021年基因行业发展研究报告

    生物科技指的是利用“生物体(含动物,植物及微生物)”来生产有用的物质或改进制成,改良生物的特性,以降低成本及创新物种的科学技术。进行对人类医学、环境、农业食粮等...

    资产信息网

扫码关注腾讯云开发者

领取腾讯云代金券