fastq-dump是SRAtoolkit中使用频率很高的命令,用于从SRA文件中拆解提取fastq文件。具体用法如下:
Usage:
fastq-dump [options] <path> [<path>...]
fastq-dump [options] <accession>
Use option --help for more information
cd ~/Seqs
fastq-dump --split-files SRR6232298.sra
详细说明请参加官方Documentation https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=toolkit_doc&f=fastq-dump 以及hiptop的简书文章: https://www.jianshu.com/p/a8d70b66794c
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