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6️⃣蛋白质序列的功能信息分析2:基于蛋白质结构域domain和功能位点分析

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Y大宽
发布2019-03-04 17:31:37
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发布2019-03-04 17:31:37
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文章被收录于专栏:Y大宽Y大宽
序列比对和序列特征分析总目录(https://cloud.tencent.com/developer/article/1388434

结构域domain比较抽象,属于蛋白质构象中二级结构和三级结构之间的一个层次,一般每个结构域有100-300个氨基酸残基组成,有特定的空间构象,并有不同的生物功能。

InterProScan数据库:online和linux(无mac和window)

nterPro将来自许多其他资源的蛋白质功能的预测信息统一在一起,概述了蛋白质所属的家族及其所包含的域和位点。

非常全面,,将UniProtDB,PROTSITE,PRINTS,PFAM,ProDom等数据库中含有的蛋白质序列的结构域,motif等合并统一,包含了蛋白质所属的家族,及其所包含的结构域和功能位点。界面如下

InterProScan

结果如下

Result

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原始发表:2019.02.02 ,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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