TCGA年度（共4年）研讨会资料分享

最近搜索很多资料，都跳转到TCGA年度（共4年）研讨会PPT了，觉得有必要再次分享，第一次分享在：http://www.bio-info-trainee.com/958.html

TCGA年度（共4年）研讨会PPT官网是： http://www.genome.gov/17516564

蛮有趣的，下面的PDF链接，可以使用 wget批量下载，或者R里面也可以，欢迎大家写出极简代码在这里分享。

假设下面的 url 被保存在 url.txt 文件里面。

wget -i url.txt 

当然，如何获取这么多url，你可能是需要自行摸索一下。

Meetings

• The Cancer Genome Atlas Fourth Annual Scientific Symposium May 11-12, 2015
• The Cancer Genome Atlas Third Annual Scientific Symposium May 12-13, 2014
• The Cancer Genome Atlas Second Annual Scientific Symposium November 27-28, 2012
• The Cancer Genome Atlas First Annual Scientific Symposium November 17-18, 2011

假设url文件如下：

http://www.genome.gov/Multimedia/Slides/TCGA1/TCGA1_.pdf 
http://www.genome.gov/Multimedia/Slides/TCGA4/24_Gross.pdf

其实有YouTube视频

虽然大部分人无法观看，但是我相信，真正感兴趣的还是能找到办法。

TCGA教程长期更新列表

• TCGA的28篇教程-使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据（cBioPortal）
• TCGA的28篇教程-使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 （离线打包版本）
• TCGA的28篇教程-使用R语言的RTCGAToolbox包获取TCGA数据 （FireBrowse portal）
• TCGA的28篇教程-批量下载TCGA所有数据 （ UCSC的 XENA）
• TCGA的28篇教程-数据下载就到此为止吧
• TCGA的28篇教程-指定癌症查看感兴趣基因的表达量
• TCGA的28篇教程-对TCGA数据库的任意癌症中任意基因做生存分析
• TCGA的28篇教程-整理GDC下载的xml格式的临床资料
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