R-数据存读

生信技能树

发布于 2019-05-23 20:24:55

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发布于 2019-05-23 20:24:55

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读取文件之前，要了解自己在哪儿（getwd()）,明了自己要去哪儿（setwd()）

我们下载一个文件操练一下（给大家点儿代入感）

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE17215

image.png

开始正题

常用的文件读取命令read.table和read.csv
常用的文件存入命令write.table和write.csv

读文件前，文件格式（分隔符）、注释内容、行名、列名等需要了解!!!
新手可以一点点儿来，参数一个一个加上去，View（）或从右上角环境变量看看效果

每个函数的参数都有很多，所以，必须了解Tab键（补全，根据你键入的信息进行联想）

#####comment.char 设置注释的标识符；skip设置跳过行数；其他的参数，大家可以自行意会
a<-read.csv('C:/Users/Administrator/Documents/test/GSE17215_series_matrix.txt')
b<-read.csv('C:/Users/Administrator/Documents/test/GSE17215_series_matrix.txt',comment.char = '!')
d<-read.csv('C:/Users/Administrator/Documents/test/GSE17215_series_matrix.txt',comment.char = '!',sep='\t')
f<-read.table('C:/Users/Administrator/Documents/test/GSE17215_series_matrix.txt',sep = '\t',fill=T,skip=66,header=T)
####dim（询问数据类型的维度）
dim(d)
dim(f)
head(d)
head(f)
tail(d)
tail(f)
write.table(x = f,file = '0418.txt')