PubMed专题:(二)搜索结果的阅读、筛选、下载、保存与利用

对文献检索来说,搜索是极为关键的第一步,直接决定了搜索结果里面有没有你想要的。因此,对PubMed搜索还不是很熟悉的读者,可以结合第一期推送教程,加以操作实练,相信定会掌握不少。

这一期,会在上一期的基础上,对搜索结果进行一个筛选、快速定位,以尽可能快的速度找到你想要的。其价值主要体现在:①加快筛选速度,快速找到想要的文献;②可弥补搜索不够精准的条件限制,加快目的文献的定位。

OK,进入主题。

1.搜索结果

PubMed搜索引擎的工作方式基本上类似于Internet搜索引擎。您输入关键字或短语,PubMed会返回相关的引文。

当我们开始搜索后,搜索结果的界面如下:

接着,如何看每一个搜索到的文献信息呢?

请看下图:(为更好地高级搜索的配合,故用英语来展示)

在这里:稍稍说下:PMID(全称PubMed Unique Identifier,唯一标识码),用于为PubMed搜索引擎中收录的生命科学和医学等领域的文献编号。因此,用PMID号搜索,基本一个搜索一个准,DOI也一样。

2.搜索结果的快速定位

在把搜索结果页面给理清后,清楚其板块设置后,那么,结合我们搜索的需要,则需要从那么多结果里面找到我们想要的。因此,在搜索结果里找我们需要的,就需跨越一道障碍——筛选。

那么,如何筛选,我们不妨先看有哪些筛选条件。

2.1

筛选条件

事实上,所谓的筛选条件,也是为挑选目的文献而服务的。因此,PubMed上的许多筛选条件还是蛮到位的,对我们筛选文献来说。

结合我们的需要来说,我们在筛选文献的时候,考虑的因素主要有以下几个:

1. 文献类型(综述,临床案例等) 2. 出版时间(当然越新越好) 3. 期刊IF(很重要的一点,IF过低,不排除会被质疑的可能) 4. 文献附带资源(是否有基因测序的数据等等) 5. 文献的研究类型(单纯的meta分析,还是随机对照实验?)等。

当知道在筛选时候会考虑的一些因素,那么,我们去创建了这些筛选条件,是否就可以更好的区解决这些问题呢?答案不言而喻。

2.2

筛选条件的创建

事实上,这些筛选条件在PubMed上都是存在的,只是需要你注册了它的账号,才可以进一步的使用这些已存在的筛选条件。

因此,在创建筛选条件之前,需要大伙必须要做到的一件事:注册一个NCBI账号,且登录,两者缺一不可。

当我们完成NCBI账号的登录后,我们可以在PubMed首页,随机搜索点什么进入搜索结果页面,后点击右侧的“Manage Filters”,进入创建筛选条件页面;或在PubMed首页,点击My NCBI,拉到底,看过Filters,点击Manage Filters即进入条件创建界面。

那么,这样就进入了创建条件的界面,先大概看下界面。

那么,进入到该界面,即可创建条件了。

但是,条件有两类,不同条件的创建方法不一致。

一、PubMed家提供的条件。PubMed家提供的过滤条件非常多,笔者相信可以满足大部分的需求,除了IF筛选(后面讲)。激活操作如下图,选择,打钩,激活。

二、自己创建的条件。这个就涉及到三个问题:

一是自己创建的条件语法能否被PubMed所识别,即是否可以用?

二是自己可以创建哪些条件?

三是自己想创建的条件,条件语法从哪来?

笔者认为,自己创建的期刊IF区间筛选就差不多了,其余的过滤条件可由PubMed家来提供。

2.3

IF筛选

请参考下方链接的IF筛选部分。

放“简单操作,Firefox让PubMed的JCR分区、IF、引用数尽显,文献秒下”推文连接

3. 保存并导出您的搜索

PubMed的又一个很酷的功能——保存搜索功能。此功能允许您保存,组织和导出搜索结果。有多种方法可以保存您的搜索:

  • 剪贴板 - 暂时保存一个或多个搜索结果(在8小时不活动后删除)
  • 收藏夹 - 在myNCBI帐户中保存结果的更永久的方法(你可以创建和自定义你自己的收藏夹)
  • 文件 - 导出搜索结果的文本文件并将其保存到你的计算机
  • 引文管理器 - 将结果导出到引文管理软件(例如,Endnote等)
  • 电子邮件 - 不言自明。

重要提示:如果要保存特定搜索结果,请务必单击圆圈字段以选择单个结果。否则,将保存整个搜索结果。

接下来,以筛选到的文献结果,实现从PubMed导入到Endnote,以便我们后续的文献管理。

第1部分

从PubMed导出

01

在PubMed中执行搜索。

02

选中你要下载的引文的文章旁边的框。如果你要进行多次搜索,请将项目保存到剪贴板,即PubMed中的临时存储空间。你可以通过从发送到菜单中选择剪贴板来完成此操作。如果你这样做,一个剪贴板图标,并在项目的数量剪贴板会在页面的右上方显示。要查看剪贴板上的项目,请单击“剪贴板”图标旁边的项目链接。

03

准备好导出结果后,单击结果或剪贴板右上角的“发送到”菜单。选择引文管理器。然后,单击“创建文件”按钮。

04

将出现一个对话框,提示“打开”或“保存”你正在创建的文本文件。选择“保存文件”按钮。然后单击确定。

05

该文件将保存到您的计算机;记下保存文件的位置,以便您可以在下一步中找到它。您已成功将引文从PubMed导出,并准备将其导入EndNote。

第2部分

导入EndNote

01

转到EndNote并打开要存储引用的库。

02

单击文件菜单,然后选择导入>文件。将出现“导入文件”对话框。

03

单击“选择”,然后选择刚刚从PubMed保存的文件。

04

在导入选项下,单击其他筛选器。这将带您进入“选择导入过滤器”对话框。选PubMed(NLM)。单击选择。这将带您返回“导入文件”对话框。

05

在“重复项”下,建议你从下拉菜单中选择“ 放弃重复项 ”。这将导入除重复之外的所有引用。

06

完成后单击“ 导入”。

那么,你在PubMed中的引用现在应该在您的Endnote库中。

注意:一旦完成这些步骤,PubMed(NLM)将在下次导入文件时出现在“导入选项”下拉菜单中。

4.下载

请参考下方链接:基于Firefox的升级版PubMed,让你一眼看穿JCR分区、IF、引用情况

原文发布于微信公众号 - 百味科研芝士(keyanzhishi)

原文发表时间:2019-05-03

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