一个逆天的small RNA-seq数据挖掘神器

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大家好，我是白介素2同学，继续分享数据挖掘神器。

随着高通量测序技术的不断发展完善，大批量的基因组数据积累在数据库中，这个大家都很清楚。近些年，越来越多的证据表明samll non-coding RNA（sncRNAs)也发挥了很重要的调节作用。同样的，分析这些数据对物生物信息背景的研究人员而言存在诸多困难，这个时候我们就需要一款神器助攻了。

先看看大概长啥样，简洁干净清爽的界面，名字就叫SPAR，不是那个SPA。全称：Small RNA-seq Portal for Analysis of sequencing expeRiments

分析公共数据集功能

这部分功能能帮助大家分析已有的 small RNA-seq数据集，这些数据集已经整合在一个数据库中了，分析非常常方便，下面可以演示下看看怎么操作的。

选择一个数据集后，点击一下 Analyze DASHR，就能看到以下的界面，发现结果已经出来了，还贴心的提供了分析结果的链接：

接下来白介素同学就点击一下结果链接可以发现：

稍微点进去看些结果，展示下这个逆天的功能：

随便点一个看下，都是可供下载的：

再看下result部分的结果，全部分析中的结果文件都整合在这里，可以下载，都是txt, xls, 还有Rdata格式的文件，全部文件都可下载：

当然了，最简单的方式还是在这里，提供了完整的数据下载链接，分析报告等等等，可以打包下载，还有完备的htlm格式报告，方便用户浏览：

再看能得到的一些分析结果图吧，这些全部都是一次性给出在分析报告中的：

这里白介素同学就不再多放了，大家可以自己去点击试下，非常简单，除此以外，另外两个数据库的数据集也已整合完备，可以直接点击选择分析：

分析自己的数据

除了已有的公开数据可以直接分析，用户可以选择上传自己的数据进行分析，同样的界面非常简洁，只需要稍作点击选择即可：

说到这，基本上这个工具的功能就是这样了，白介素同学用过很多数据分析的工具，还头一次见到用起来这么顺手舒服的呢，长得又好看，又有才华。好了好了，介绍给大家，至少如果是samll RNA-seq的数据，有了这个，感觉那些公司的分析报告还比不上这个呢。

还是老样子，每用一个工具，最后总要介绍下是何方神圣，该神器发表在著名的 Nucleic Acids Research杂志上，大家可以放心愉快的使用了吧。

内容分享完了，白介素2同学祝大家周末愉快！（抱拳抱拳）

可爱的你，请给我点下好看