R包降级也不全是那么简单
昨天写了随心所欲对指定R包进行升级与降级，以为大家都可以很轻松做到，发现其实只是自己随心所欲了，第一因为自己的mac电脑，其次因为自己看得懂R的提示，说缺依赖包，所以需要手动安装一些依赖。
如果是Windows用户，会有一个make缺失这样的错误，如下：
虽然很多年没有使用Windows了，但实际上很容易谷歌搜索解决：
其实就是rtools缺失 问题，Windows去下载适合的版本安装即可解决。
下载安装Rtools，一次性安装到C盘（必须是C盘哦），再打开Rstudio运行packages的安装代码即可。
> packageurl <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Seurat/Seurat_2.3.4.tar.gz"
> install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")
> library(Seurat)
载入需要的程辑包：cowplot
********************************************************
Note: As of version 1.0.0, cowplot does not change the
default ggplot2 theme anymore. To recover the previous
behavior, execute:
theme_set(theme_cowplot())
********************************************************
## 迅速搞定,problem solved ~
当然，MAC用户的报错也很有趣，我们下次再讲。
后记：
实际上，早期我们做生物信息学，也会经常遇到软件安装失败的困难，后来有了conda，实际上很少有人询问软件如何安装了，反正都是 conda install 即可，有点类似于软件管家帮你解决一切痛苦烦恼，不知道R里面会不会也是这样，短期内我看docker有这个潜力。
当然，短期内，大家就只能是靠万能的谷歌啦！
本文参与 腾讯云自媒体分享计划，分享自微信公众号。
原始发表：2019-07-25，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
评论
登录后参与评论
推荐阅读