PubChem,即有机小分子生物活性数据,是一种化学模组的数据库,由美国国家健康研究院( US National Institutes of Health,NIH)支持,美国国家生物技术信息中心负责维护。
PubChem数据库包括 3个子数据库: PubChem BioAssay 库用于存储生化实验数据,实验数据主要来自高通量筛选实验和科技文献; PubChem Compound 库用于存储整理后的化合物化学结构信息; PubChem Substance 用于存储机构和个人上传的化合物原始数据
提供2D Structure,3D Conformer,SDF,ASNT,JSON,XML格式原始数据下载
包含
InChIInChI Key
XLOGP3 AA
精确分子量 Exact Mass
分子式 Molecular Formula
摩尔分子量 Molecular Weight
Canonical SMILES
ISO SMILES
TPSA
单一同位素重量 Monoisotopic Weight
总电荷 Total Charge
重原子数 Heavy Atom Count
定义原子立体中心计数 Defined Atom Stereo Center Count
未定义原子立体中心计数 Undefined Atom Stereo Center Count
定义键立体中心计数 Defined Bond Stereo Center Count
未定义键立体中心计数 Undefined Bond Stereo Center Count
同位素原子计数 Isotope Atom Count
组件计数 Component Count
自动计数 Auto Count
规范化 Canonicalized:1
复杂性 Complexity
氢键受体计数 Hydrogen Bond Acceptor Count
氢键供体计数 Hydrogen Bond Donor Count
旋转键计数 Rotatable Bond Count
子密钥 Subs key
坐标类型 Coordinate Type
键注释 Bond Annotations
http://www.pubchem.cn/
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