有机小分子生物活性数据(Pubchem)

PubChem，即有机小分子生物活性数据，是一种化学模组的数据库，由美国国家健康研究院（ US National Institutes of Health，NIH）支持，美国国家生物技术信息中心负责维护。

PubChem数据库包括 3个子数据库： PubChem BioAssay 库用于存储生化实验数据，实验数据主要来自高通量筛选实验和科技文献； PubChem Compound 库用于存储整理后的化合物化学结构信息； PubChem Substance 用于存储机构和个人上传的化合物原始数据

提供2D Structure,3D Conformer,SDF,ASNT,JSON,XML格式原始数据下载

包含

InChIInChI Key

XLOGP3 AA

精确分子量 Exact Mass

分子式 Molecular Formula

摩尔分子量 Molecular Weight

Canonical SMILES

ISO SMILES

TPSA

单一同位素重量 Monoisotopic Weight

总电荷 Total Charge

重原子数 Heavy Atom Count

定义原子立体中心计数 Defined Atom Stereo Center Count

未定义原子立体中心计数 Undefined Atom Stereo Center Count

定义键立体中心计数 Defined Bond Stereo Center Count

未定义键立体中心计数 Undefined Bond Stereo Center Count

同位素原子计数 Isotope Atom Count

组件计数 Component Count

自动计数 Auto Count

规范化 Canonicalized：1

复杂性 Complexity

氢键受体计数 Hydrogen Bond Acceptor Count

氢键供体计数 Hydrogen Bond Donor Count

旋转键计数 Rotatable Bond Count

子密钥 Subs key

坐标类型 Coordinate Type

键注释 Bond Annotations

http://www.pubchem.cn/