前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >【科研猫·绘图】优雅版·小提琴图(带R代码分享)

【科研猫·绘图】优雅版·小提琴图(带R代码分享)

作者头像
用户6317549
发布2019-09-24 16:43:23
4.7K0
发布2019-09-24 16:43:23
举报
文章被收录于专栏:科研猫

课前准备,R语言的安装和配置都OK了吗?生物信息系列课程-R语言入门挖掘GEO速成SCI文章系列教程(3)-R语言基础。小板凳排排坐,飞飞老师要开课~

上次教程中,我们从最常用的一个图形入手:箱线图。给大家讲解并绘制了箱线图,画出来的图是这样子的。

昨天的箱线图出来后,很多同学觉得还不够过瘾,想知道有没有更炫酷的画法来表征不同组别间的统计数据呢,当然有!

今天就教大家来画一种非常知性优雅(一眼万年那种的~)的图形:小提琴图

小·提·琴·图

定义:Violin plot,和Boxplot一样,也是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图,其形状类似小提琴。它主要用于反映原始数据分布的特征,还可以进行多组数据分布特征的比较。

解读:小提琴图是【箱线图】与【核密度图】的结合,箱线图展示了分位数的位置,核密度图则展示了任意位置的密度,通过小提琴图可以知道哪些位置的数据点聚集的较多,因其形似小提琴而得名。如下图所示,其外围的曲线宽度代表数据点分布的密度,中间的箱线图则和普通箱线图表征的意义是一样的,代表着中位数、上下分位数、极差等。

绘制方法:使用ggplot2包的geom_violin()函数绘制小提琴图,为了更好地表征数据分布,再用geom_boxplot()函数叠加一个箱线图。

绘图操作:使用科研猫提供的提琴图·R代码,只要提供几个参数即可:

(1)设置用来绘图的数据文件;

(2)设置小提琴的颜色,可以是red、blue、green等各种颜色,当你想绘制多种颜色时,使用“random”;

(3)设置x轴的标签;

(4)设置y轴的标签

然后直接运行代码即可。

只需短短几秒,你就会彻底爱上我们的代码,我们的小提琴图。超高颜值、时尚穿搭,editor都说爱了呢。

讲师简介:

飞飞老师,绰号“小飞鼠”,国家重点实验室生物信息学博士,生物信息及动画专业双985学士,有近十年科研绘图经验,精通R、Python、Perl等多门编程语言及Photoshop、Illustrator、InDesign、After Effects、Cinema 4D、Maya等制图软件,已发表多篇高质量SCI论文(包括10分以上两篇),并多次操刀设计Journal封面绘图。授课经验丰富,已辅导学员完成论文绘图近千张,辅导发表SCI论文80余篇。下面我们一起按照由易到难的顺序,一起来欣赏一下飞飞老师的大作吧:

1. 初级统计绘图

2.复杂统计绘图

3.流程图、机器学习、三维制图

4.复杂三维绘图、杂志封面

更多科研新鲜资讯、文献精度和生物信息技能,请关注科研猫公众号

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2019-05-17,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 科研猫 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档