【科研猫·绘图】优雅版·小提琴图（带R代码分享）

课前准备，R语言的安装和配置都OK了吗？生物信息系列课程-R语言入门；挖掘GEO速成SCI文章系列教程（3）-R语言基础。小板凳排排坐，飞飞老师要开课~

上次教程中，我们从最常用的一个图形入手：箱线图。给大家讲解并绘制了箱线图，画出来的图是这样子的。

昨天的箱线图出来后，很多同学觉得还不够过瘾，想知道有没有更炫酷的画法来表征不同组别间的统计数据呢，当然有！

小·提·琴·图

定义：Violin plot，和Boxplot一样，也是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图，其形状类似小提琴。它主要用于反映原始数据分布的特征，还可以进行多组数据分布特征的比较。

解读：小提琴图是【箱线图】与【核密度图】的结合，箱线图展示了分位数的位置，核密度图则展示了任意位置的密度，通过小提琴图可以知道哪些位置的数据点聚集的较多，因其形似小提琴而得名。如下图所示，其外围的曲线宽度代表数据点分布的密度，中间的箱线图则和普通箱线图表征的意义是一样的，代表着中位数、上下分位数、极差等。

绘制方法：使用ggplot2包的geom_violin()函数绘制小提琴图，为了更好地表征数据分布，再用geom_boxplot()函数叠加一个箱线图。

绘图操作：使用科研猫提供的提琴图·R代码，只要提供几个参数即可：

（1）设置用来绘图的数据文件；

（2）设置小提琴的颜色，可以是red、blue、green等各种颜色，当你想绘制多种颜色时，使用“random”；

（3）设置x轴的标签；

（4）设置y轴的标签

然后直接运行代码即可。

只需短短几秒，你就会彻底爱上我们的代码，我们的小提琴图。超高颜值、时尚穿搭，editor都说爱了呢。

讲师简介：

飞飞老师，绰号“小飞鼠”，国家重点实验室生物信息学博士，生物信息及动画专业双985学士，有近十年科研绘图经验，精通R、Python、Perl等多门编程语言及Photoshop、Illustrator、InDesign、After Effects、Cinema 4D、Maya等制图软件，已发表多篇高质量SCI论文（包括10分以上两篇），并多次操刀设计Journal封面绘图。授课经验丰富，已辅导学员完成论文绘图近千张，辅导发表SCI论文80余篇。下面我们一起按照由易到难的顺序，一起来欣赏一下飞飞老师的大作吧：

1. 初级统计绘图

2.复杂统计绘图

3.流程图、机器学习、三维制图

4.复杂三维绘图、杂志封面

更多科研新鲜资讯、文献精度和生物信息技能，请关注科研猫公众号