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文献推荐:影像组学评分是基于影像学特征的一个单发HCC患者术后生存的预后指标

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百味科研芝士
发布2019-11-18 12:44:33
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发布2019-11-18 12:44:33
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今天献丑了,分析的是ZBH和LLZ两位师兄的临床评分文章(我能大概读懂结果和思路,但是方法学一窍不通)。如有不妥之处,请多多指点。

这篇文章发表在BMC Cancer上,分数不高,但我个人看来这篇文章还是有很多值得学习之处。

现在作为HCC患者预后的评分系统有很多,之前分析的ALBI就是其中之一。今天的这个放射组学评分我也拿出来看一下。

Methods

1. 首先来看样本的入选标准:训练队列212人,验证组107人。下面看看flow chart:

(数据丢失太多,最后导致的样本量小,这可能是文章的不足之处,偏倚大)

2. 两个结局指标是:复发间隔期TTR和总生存期OS

3. 用Matlab 做增强CT动脉期影像的质构分析,GCLM灰度共生矩阵获取110个放射学特征。之后质构分析texture analysis(emmm...不会怎么搞)

4. 观察者间或观察者内的放射组学特征提取的可重复性:60个影像(为什么是60个???不是600个?)用来评估不同观察者间(10年经验医师vs5年经验医师)的可重复性。1观察者内可重复性验证:10年经验医师1周两次做两次同样的质构分析。intraclass correlation coefficient(ICC,同类相关系数)用来评估者间和者内质构分析结构的差异。(em.....不会怎么搞)

5. 质构分析的影像学特征的挑选+rad评分系统的建立:(前面这个10倍这个没看懂)用R语言的glmnet包做lasso-logistic regression从110个rad特征里筛出6个(用训练队列212人计算的)。RMS包用来计算rad评分公式:

6. 统计分析用的SPSS或R的rms包X-tile用来取rad-score的cut-off值(X-tile是一种可以区别肿瘤亚群、判定biomarker和结局关联性强度的工具,非常想学)。其他方法包括生存KM曲线、COX回归、C-index、校正曲线、诺谟图

个人感悟:可以看出丰富的方法学手段为一个简单的idea添砖加瓦,锦上添花,提升档次。

Results

1. 319个病人临床基线表:(年龄、性别、肿瘤大小、血管侵犯、微血管侵犯、肿瘤分化、肝硬化、乙肝、包膜、术前血生化DB、TB、ALT、AST、AFP、ALB、GGT)

2. 者间和者内可重复性很好(ICC很高)

3. rad评分与临床特征的联系:用X-tile得出rad4.32分的cut-off值,把319人分为二分类(rad分高低两组)。然后再做了个多因素分析:低rad分与高AFP、肿瘤大、血管侵犯、TNM和BCLC高分期有关。(多因素表应该是S1,但网站上并未提供,估计被杂志社吃了吧)

4. 低rad评分与低生存有关:做KM曲线看两个队列的TTR和OS,再做了个术后复发和术后生存的COX多因素(见table),可以看出rad评分可以作为独立预测因素。

5. 做rad分评级TTR和OS的nomogram和其校正图+C-index验证nomogram的准确性,Hosmer-Lemeshow test验证了预测校准取消和理想校准曲线无统计学差异

6. 比较rad评分的nomogram与传统TNM,BCLC,JIS,HKLC评分:还是见上图C-index的table 4,最后发现rad-score的nomogram最准确。

7. rad评分增强其他评分的准确性:见table 4。rad评分对于临床指标、TNM、BCLC等评分系统有补充作用,将rad评分与上述评分整合到一起,C-index明显提升。

这么丰富的方法学我也是看了一天,并且还不会,但是能大概缕出个思绪:

  1. 先筛好影像学特征并做好rad评分
  2. 设定cut-off证明rad评分与预后差有关
  3. 再做KM生存曲线(TTR+OS)
  4. 再做rad-score诺谟图
  5. 比较rad-score 诺谟图与其他评分系统的准确性c-index。
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原始发表:2019-11-15,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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