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肿瘤异质性简介

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生信修炼手册
发布2019-12-19 10:50:20
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发布2019-12-19 10:50:20
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文章被收录于专栏:生信修炼手册生信修炼手册

肿瘤异质性tumor heterogeneity,是恶性肿瘤的特征之一,可以使肿瘤在生长速度,侵袭与转义,预后等各方面产生差异。

肿瘤异质性的体现形式多种多样,可以简单划分为以下两类

  1. 肿瘤间异质性,inter-tumor heterogeneity, 不用类型肿瘤的细胞存在基因型和表型差异
  2. 肿瘤内异质性,intra-tumor heterogeneity,同一种肿瘤其细胞也存在基因型和表型差异

示意图如下

对于瘤内异质性,又存在不同治疗阶段的时间异质性, 原发和转移肿瘤间的空间异质性等。除此之外,肿瘤微环境之间,肿瘤细胞和肿瘤循环细胞之间,同一肿瘤组织的不同肿瘤细胞也存在异质性。

深入研究肿瘤异质性,有助于了解肿瘤产生的机制,演化规律,解释治疗过程中耐药性等产生的原因,结合不同肿瘤类型和时期,为患者量身定制个性化的治疗方案,更好的实现精准医疗。

关于肿瘤异质性产生的机制,有以下两种假说

1. clonal evolution model

克隆进化模型, 肿瘤细胞群起源与单个细胞,在增殖的过程由于多次突变分化成了不同的亚克隆细胞群,示意如下

该模型又可以进一步划分为线性进化和分支进化模型, 图示如下

线性进化模型描述的肿瘤细胞向着具有生长优势的克隆进化,相比祖先克隆,顺序克隆包含更多的有力突变;分支进化模型中多个亚克隆具有相同的祖先克隆,不同分支的进化大大增加了肿瘤异质性。

2. cancer stem cell model

肿瘤干细胞模型,肿瘤组织内内可以分为肿瘤干细胞和其他细胞两大类,随着肿瘤干细胞的增殖和分化,形成了肿瘤异质性,其他细胞经过几次分化后最终死亡, 示意图如下

目前有各种检测手段可以用于肿瘤异质性的研究,以NGS测序为主的技术手段由于其通量高,检测周期快等特性占据半壁江山,根据检测对象的不同,细分为循环肿瘤DNA(ctDNA), 循环肿瘤细胞(CTC),血液中游离的DNA(cfDNA), 肿瘤组织DNA,在对应的数据分析中,除了常规的call variants外,预测肿瘤亚克隆结构也是一项核心的分析内容。

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原始发表:2019-08-12,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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