aCGH芯片简介

aCGH全称如下

array-based Comparative genomic hybridization

称之为基于芯片的比较基因组杂交技术，是一项用于检测两个样本间DNA拷贝数的变化的技术，其中一个样本为对照样本，另外一个样本为实验样本。将两个样品的DNA用红绿两种荧光进行标记，然后与芯片进行杂交，借用专门的数据分析软件检测红绿两种荧光的比值，来分析相对对照样本，实验样本的DNA拷贝数是增加还是减少。

相比细胞遗传学中常用的染色体核型分析等传统技术， aCGH芯片覆盖率和分辨率都大大提高， 以最主流的安捷伦aCGH芯片为例，官方给出的分辨率和覆盖度如下

aCGH芯片的处理流程示意如下

主要分为四个步骤，第一步抽提样品DNA, 分别用绿色和红色荧光标记;第二步将标记之后的DNA混合并与芯片杂交；第三步用荧光扫描仪芯片上的荧光信号；第四步通过软件分析荧光信号，识别拷贝数的增加或减少。

在上述示意图的最后一个直线图部分，是CNV分析最常见的结果展现形式，以二倍体为例，正常情况下默认拷贝数都为2份，用0表示，-1表示缺失了1份拷贝，称之为杂合性缺失，-2表示缺失了2份拷贝，称之为纯合性缺失；+1表示多了一份拷贝，变为3拷贝，+2表示多了两份拷贝，变为4拷贝。软件最原始的输入数据为荧光的信号值，信号值是有波动的，对应图中的黑色散点，而拷贝数一定是一个整数，算法通过对原始的荧光信号值进行拟合，确定对应染色体片段的拷贝数水平。

aCGH芯片在检测CNV方面的高灵敏度，高分辨率，使得该技术成为了检测CNV的金标准之一，通过配套的成熟数据分析软件，可以方便的检测和分析各类样本中的CNV变异。