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GWAS公开结果哪里找,GWAS Catalog来帮忙

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生信修炼手册
发布2019-12-19 12:58:43
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发布2019-12-19 12:58:43
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GWAS Catalog是EBI旗下的一个数据库,收录了公开发表的GWAS分析结果,截止2019-11-21,收录了16万个SNP位点和疾病之间的关联信息,更多信息汇总如下

通过官网,可以方便的检索,查询和下载对应的信息,常用的有以下3个模块

1. Search

可以根据以下多种条件进行检索

  1. publications
  2. variants
  3. traits
  4. genes
  5. region

以突变位点rs7329174为例,检索结果包含了位点的染色体位置和对应基因,关联分析的详细结果,关联性状的描述,LD等信息。关联分析的结果示意如下

2. Diagram

以疾病为单位进行检索,查看每种疾病所有相关SNP位点的结果,示意如下

展示了所有关联的SNP位点在染色体上的分布,每个点代表一个study的结果,鼠标点击可以查看详细信息。

3. Download

下载关联分析的结果,提供了多种格式的结果供下载

通过该网站,可以方便的查询和下载已经发表的GWAS分析结果。

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原始发表:2019-12-07,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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