3D Genome Browser:Hi-C数据可视化工具

对于chip_seq的数据，我们可以通过UCSC, igvtools等基因组浏览器来展示和查看相应的数据，而对于三维基因组学的结果信息，这些二维基因组浏览器就不能够有效的进行展示了。随着三维基因组学的发展，相关的可视化软件也越来越多, 3D Genome Browser就是其中一个，是一个用于展示三维基因组学数据的在线网站，网址如下

http://promoter.bx.psu.edu/hi-c/index.html

对应文章的链接如下

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-018-1519-9

可以展示以下多种信息

1. Hi-C
2. ChIA-PET
3. Capture Hi-C

对于Hi-C数据，可以查看已发表的公共数据集的结果，也可以展示自己的数据分析结果，通过如下所示的步骤，选择展示的数据和对应的染色质区域

结果示意如下

除了展示单一的Hi-C数据，还支持导入UCSC或者Epigenome 基因组浏览器中的chip_seq, RNA_seq等二维结果。在下图所示的红框出输入数据的URL链接

然后点击update即可，支持同时展示多个二维数据集，结果示意如下

该网站也提供了Promoter Capture Hi-C数据的展示，但是只支持公共数据集，通过下图所示的步骤选择对应的数据集

展示结果示意如下

以上这些都是该网站最基本的功能，更多功能和用法详见文章和官网的帮助文档。