EnhancerAtlas:人和小鼠的增强子数据库

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EnhancerAtlas结合三种高通量数据的分析结果来预测人和小鼠中的增强子，该数据库最新版本为v2.0, 网址如下

http://www.enhanceratlas.org/index2.php

对于人类增强子，基于hg19基因组版本进行预测，目前包含来自170种细胞或组织共共4,506,217个增强子信息；对于小鼠增强子，基于mm9基因组版本进行预测，目前包含来自150种细胞或组织共2,811,699个增强子信息。

支持直接输入基因名称或者基因组特定区域，查看在该区域内的增强子，示意如下

检索结果示意如下

采用了基因组浏览器的展示形式，每一行称之为track, 黑色字体对应行表示每种方法检测到的该区域reads覆盖结果，红色字体对应行为综合多种方法得到的增强子区域的结果。

在结果页面，可以下载该区域包含的增强子的fasta序列文件，示意如下

也可以比较增强子在不同细胞系中的表达，检索框示意如下

检索结果示意如下

可以直观比较不同细胞系中增强子的表达情况。该数据库还支持展示增强子和基因之间的调控网络，检索框示意如下

调控网络的结果如下所示

除了在线检索功能外，该数据库中的数据还可以免费下载，无论是不同细胞系中增强子区间，还是增强子和基因间的调控网络，都可以直接下载得到。对于增强子研究而言，该数据库非常值得参考。

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