HiGlass:高度定制的Hi-C数据可视化应用

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HiGlass是一个hi-C数据可视化的web应用，参考UCSC基因组浏览器和juicebox中数据的展示形式，运用D3.js等流行的可视化框架对数据进行展示，基于web技术提升了用户的交互体验，缺点就是需要搭建过程比较繁琐。网址如下

http://higlass.io/about

和其他基因组浏览器类似，将每种需要展示的信息定义为tracks, 提供了一下不同的展现形式

下列网址是一个demo网站，展示了HiGlass的各种视图

http://higlass.io/

1. single view

单个视图窗口，用于展示单个hi-c图谱，基本展现形式如下

用热图的形式展现hi-c图谱，允许通过鼠标进行缩放，或者通过搜索框指定基因组区域。

2. two linked views

相互关联的两个窗口，两个窗口展示的基因组区域是同步的，可以方便的比较两个Hi-C图谱的异同，示意如下

3. genome browser-like view

像基因组浏览器一样展示数据，示意如下

当然还有更多的展现形式，综合运用各种views, 可以灵活的进行定制，创建出很多高大上的展现形式，下面网址是一些示例

http://higlass.io/examples

通过编辑配置文件，可以对可视化的数据和形式进行精细的调整，比如下图中修改热图的配色等

HiGlass的使用门槛较高，但是其展示形式更加多样，生成的效果图也更加美观，是一款hi-c数据可视化的利器，更多用法请参考官方文档。

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