遗传评估分析之模板文章

1. 参考文献

伊犁马体尺性状非遗传因素分析及遗传参数估计[J]. 畜牧兽医学报, 2017(10).

2. 试验数据描述

研究所用数据取自伊犁某2个规模化养马场及参加伊犁马常态化赛事参赛马匹。数据中的体尺指标包括体高(体长(胸围和管围)4个性状。

3. 固定因子划分

• 场
• 性别
• 年龄
• 出生年度

4. 数据清洗标准

• 提出错误数据
• 删除3倍标准差数据

5. 统计分析

5.1 表型数据汇总统计

• 数量
• 平均值
• 最大值
• 最小值
• 方差
• 标准差
• 变异系数

5.2 固定因子检验（方差分析）

使用SAS的GLM模型，对固定因子进行检验。

5.2 方差分析中的预测均值的多重比较

• 固定因子1多重比较
• 固定因子2多重比较
• ......

5.3 方差组分评估

使用MTDFRE软件，进行遗传参数评估

5.4 计算遗传力，遗传相关，表型相关

遗传力公式：

遗传相关公式：

表型相关公式：

5.5 遗传相关和表型相关的显著性检验

• LRT检验

6. 结果分析

6.1 汇总统计结果

6.2 方差分析结果（固定因子）

6.3 固定因子的多重比较

6.4 遗传力 遗传相关 表型相关

7. 可以增加的分析

• 固定因子可以随着方差组分一起评估，没有必要单独用GLM进行分析
• 文章只给出了表型相关的显著性检验，没有给出遗传相关的显著性检验
• 遗传评估的目的是计算育种值，可以给定选择指数，计算综合育种值