网页工具推测非编码RNA的生物学功能（lncRNA表达矩阵免费分析）

如果我们最后拿到的是蛋白编码基因，当然可以很容易的注释到各种数据库，比如：Gene Ontology terms, KEGG, Reactome, NetPath, PID, INOH and BioCarta pathways ，这些数据库本质上都是一些被定义好的基因集而已。

但是lncRNA本身是没有蛋白编码基因那样长远的研究历史，没有海量的生物学实验数据的积累，所以仍然是需要通过跟蛋白编码基因的表达相关性来间接推测lncRNA的功能，这就需要理论模型和算法支持，LncRNA2Function网页工具就是其中一个选择！

作为一个工具，这个不到100的引用量只能说是马马虎虎吧，当然了，本身这个杂志就是专门发生物信息学文章的杂志，影响因子都不到3，而这个工具的100左右的引用，其实是大大帮助了这个杂志。

The lncRNA2Function is freely available at http://mlg.hit.edu.cn/lncrna2function.

通过表达量相关性来关联lncRNA与蛋白编码基因

实际上，仅仅是凭表达量的相关性就认为某个lncRNA就一定是与它共表达的编码蛋白质的基因的功能一致或者类似，是一个假设而已。

文章里面的描述是

In this study, based on expression correlation between lncRNAs and protein-coding genes across 19 human normal tissues, we used the hypergeometric test to functionally annotate a single lncRNA or a set of lncRNAs with significantly enriched functional terms among the protein-coding genes that are significantly co-expressed with the lncRNA(s).

An external file that holds a picture, illustration, etc. Object name is 1471-2164-16-S3-S2-1.jpg

如果是想探索LncRNA在疾病研究方向的成果，还可以通过FARNA网页工具，依赖的是KEGG Orthology Based Annotation System (KOBAS)数据库，其也是多种数据库的整合，包括， KEGG DISEASE, GAD and NHGRI GWAS Catalog disease databases.