前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >实时追踪,用 Python 画新型肺炎疫情地图

实时追踪,用 Python 画新型肺炎疫情地图

作者头像
GitHubDaily
发布2020-02-21 15:02:21
1.2K0
发布2020-02-21 15:02:21
举报
文章被收录于专栏:GitHubDailyGitHubDaily

公众号关注 “GitHubDaily”

设为 “星标”,每天教你学编程!

作者 | 天元浪子

编辑 | 胡巍巍

近日,在笔者的微信群里,白垩老师问如何用 Python 画武汉肺炎疫情地图。白垩老师是研究海洋生态与地球生物的学者,国家重点实验室成员,于不惑之年学习 Python,实为我等学习楷模。

先前我并没有关注武汉肺炎的具体数据,也没有画过类似的数据分布图。于是就拿了两个小时,专门研究了一下,遂成此文。

数据下载

网上一搜,首先搜到的是腾讯的疫情实时追踪,那就用这个数据源吧。

有了网址怎么抓数据呢?这里,我送大家一双火眼金睛,可以从纷乱中找到最靠谱的下载方式。我习惯用 Firefox 浏览器,下面的讲解就以 Firefox 为例(其他浏览器基本类似)。

打开菜单,点击 “Web 开发者”,在递进菜单中选择 "网络":

刷新页面,我们很快就能发现,应答类型为 JSON 格式的这个请求,最有可能包含我们需要的数据了:

深入分析,我们就得到了 URL 地址、请求方法、参数、应答格式等信息。查询参数中,Callback 是回调函数名,我们可以尝试置空,而 “_” 应该是以毫秒为单位的当前时间戳。

有了这些信息,分分钟就可以抓到数据了。我们先在 IDLE 中以交互方式抓一下看看效果:

代码语言:javascript
复制
>>> import time, json, requests
>>> url = 'https://view.inews.qq.com/g2/getOnsInfo?name=wuwei_ww_area_counts&callback=&_=%d'%int(time.time()*1000)
>>> data = json.loads(requests.get(url=url).json()['data'])
>>> print(len(data))
301
>>> print(data[0])
{'country': '中国', 'area': '湖北', 'city': '武汉', 'confirm': 698, 'suspect': 0, 'dead': 63, 'heal': 42}
>>> print(data[-1])
{'country': '中国', 'area': '山东', 'city': '枣庄', 'confirm': 2, 'suspect': 0, 'dead': 0, 'heal': 0}

只要两行代码,就可以抓到数据了。怎么样,是不是超级简单?

数据处理

以省为单位画疫情图,我们只需要统计同属一个省的所有地市的确诊数据即可。最终的数据抓取代码如下:

代码语言:javascript
复制
import time, json, requests

def catch_distribution():
    """抓取行政区域确诊分布数据"""

    data = dict()
    url = 'https://view.inews.qq.com/g2/getOnsInfo?name=wuwei_ww_area_counts&callback=&_=%d'%int(time.time()*1000)
    for item in json.loads(requests.get(url=url).json()['data']):
        if item['area'] not in data:
            data.update({item['area']:0})
        data[item['area']] += int(item['confirm'])

    return data

数据可视化

数据可视化,我习惯使用 Matplotlib 模块。Matplotlib 有很多扩展工具包(Toolkits),比如,画 3D 需要 mplot3d 工具包,画地图的话,则需要 Basemap 工具包,以及处理地图投影的 Pyproj 模块。

另外画海陆分界线、国界线、行政分界线等还需要 Shape 数据。所需模块请自行安装,Shape 文件可以从这里下载 (https://github.com/dongli/china-shapefiles)。

绘图用到的矢量字库可以从自己的电脑上随便找一个(我用的是 simsun.ttf)。我的主程序是 2019nCoV.py,Shape 文件下载下来之后,是这样保存的:

以下为全部代码,除了疫情地图,还包括了全国每日武汉肺炎确诊数据的下载和可视化。

代码语言:javascript
复制
# -*- coding: utf-8 -*-

import time
import json
import requests
from datetime import datetime
import numpy as np
import matplotlib
import matplotlib.figure
from matplotlib.font_manager import FontProperties
from matplotlib.backends.backend_agg import FigureCanvasAgg
from matplotlib.patches import Polygon
from matplotlib.collections import PatchCollection
from mpl_toolkits.basemap import Basemap
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.dates as mdates

plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['FangSong']  # 设置默认字体
plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False  # 解决保存图像时'-'显示为方块的问题

def catch_daily():
    """抓取每日确诊和死亡数据"""

    url = 'https://view.inews.qq.com/g2/getOnsInfo?name=wuwei_ww_cn_day_counts&callback=&_=%d'%int(time.time()*1000)
    data = json.loads(requests.get(url=url).json()['data'])
    data.sort(key=lambda x:x['date'])

    date_list = list() # 日期
    confirm_list = list() # 确诊
    suspect_list = list() # 疑似
    dead_list = list() # 死亡
    heal_list = list() # 治愈
    for item in data:
        month, day = item['date'].split('.')
        date_list.append(datetime.strptime('2020-%s-%s'%(month, day), '%Y-%m-%d'))
        confirm_list.append(int(item['confirm']))
        suspect_list.append(int(item['suspect']))
        dead_list.append(int(item['dead']))
        heal_list.append(int(item['heal']))

    return date_list, confirm_list, suspect_list, dead_list, heal_list

def catch_distribution():
    """抓取行政区域确诊分布数据"""

    data = {'西藏':0}
    url = 'https://view.inews.qq.com/g2/getOnsInfo?name=wuwei_ww_area_counts&callback=&_=%d'%int(time.time()*1000)
    for item in json.loads(requests.get(url=url).json()['data']):
        if item['area'] not in data:
            data.update({item['area']:0})
        data[item['area']] += int(item['confirm'])

    return data

def plot_daily():
    """绘制每日确诊和死亡数据"""

    date_list, confirm_list, suspect_list, dead_list, heal_list = catch_daily() # 获取数据

    plt.figure('2019-nCoV疫情统计图表', facecolor='#f4f4f4', figsize=(10, 8))
    plt.title('2019-nCoV疫情曲线', fontsize=20)

    plt.plot(date_list, confirm_list, label='确诊')
    plt.plot(date_list, suspect_list, label='疑似')
    plt.plot(date_list, dead_list, label='死亡')
    plt.plot(date_list, heal_list, label='治愈')

    plt.gca().xaxis.set_major_formatter(mdates.DateFormatter('%m-%d')) # 格式化时间轴标注
    plt.gcf().autofmt_xdate() # 优化标注(自动倾斜)
    plt.grid(linestyle=':') # 显示网格
    plt.legend(loc='best') # 显示图例
    plt.savefig('2019-nCoV疫情曲线.png') # 保存为文件
    #plt.show()

def plot_distribution():
    """绘制行政区域确诊分布数据"""

    data = catch_distribution()

    font = FontProperties(fname='res/simsun.ttf', size=14)
    lat_min = 0
    lat_max = 60
    lon_min = 70
    lon_max = 140

    handles = [
            matplotlib.patches.Patch(color='#ffaa85', alpha=1, linewidth=0),
            matplotlib.patches.Patch(color='#ff7b69', alpha=1, linewidth=0),
            matplotlib.patches.Patch(color='#bf2121', alpha=1, linewidth=0),
            matplotlib.patches.Patch(color='#7f1818', alpha=1, linewidth=0),
]
    labels = [ '1-9人', '10-99人', '100-999人', '>1000人']

    fig = matplotlib.figure.Figure()
    fig.set_size_inches(10, 8) # 设置绘图板尺寸
    axes = fig.add_axes((0.1, 0.12, 0.8, 0.8)) # rect = l,b,w,h
    m = Basemap(llcrnrlon=lon_min, urcrnrlon=lon_max, llcrnrlat=lat_min, urcrnrlat=lat_max, resolution='l', ax=axes)
    m.readshapefile('res/china-shapefiles-master/china', 'province', drawbounds=True)
    m.readshapefile('res/china-shapefiles-master/china_nine_dotted_line', 'section', drawbounds=True)
    m.drawcoastlines(color='black') # 洲际线
    m.drawcountries(color='black')  # 国界线
    m.drawparallels(np.arange(lat_min,lat_max,10), labels=[1,0,0,0]) #画经度线
    m.drawmeridians(np.arange(lon_min,lon_max,10), labels=[0,0,0,1]) #画纬度线

    for info, shape in zip(m.province_info, m.province):
        pname = info['OWNER'].strip('\x00')
        fcname = info['FCNAME'].strip('\x00')
        if pname != fcname: # 不绘制海岛
            continue

        for key in data.keys():
            if key in pname:
                if data[key] == 0:
                    color = '#f0f0f0'
                elif data[key] < 10:
                    color = '#ffaa85'
                elif data[key] <100:
                    color = '#ff7b69'
                elif  data[key] < 1000:
                    color = '#bf2121'
                else:
                    color = '#7f1818'
                break

        poly = Polygon(shape, facecolor=color, edgecolor=color)
        axes.add_patch(poly)

    axes.legend(handles, labels, bbox_to_anchor=(0.5, -0.11), loc='lower center', ncol=4, prop=font)
    axes.set_title("2019-nCoV疫情地图", fontproperties=font)
    FigureCanvasAgg(fig)
    fig.savefig('2019-nCoV疫情地图.png')

if __name__ == '__main__':
    plot_daily()
    plot_distribution()

2019-nCoV 疫情曲线:

2019-nCoV 疫情地图:

上图为圆柱投影,这也是 Basemap 默认的投影模式,我们还可以换用其他投影模式,比如兰勃托等角投影,只需要将 97 行代码改为:

代码语言:javascript
复制
m = Basemap(projection='lcc', width=5000000, height=5000000, lat_0=36, lon_0=102, resolution='l', ax=axes)

兰勃托投影效果如下:

还可以使用正射投影:

代码语言:javascript
复制
m = Basemap(projection='ortho', lat_0=30, lon_0=105, resolution='l', ax=axes)

正射投影效果如下:

本文为 CSDN 博主「天元浪子」的原创文章。原文链接:

https://blog.csdn.net/xufive/article/details/104093197

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-02-03,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 GitHubDaily 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档