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可视化冠状病毒全球态势

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代码医生工作室
发布2020-03-05 11:13:20
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发布2020-03-05 11:13:20
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文章被收录于专栏:相约机器人

作者 | Sayar Banerjee

来源 | Medium

编辑 | 代码医生团队

总览

冠状病毒(COVID-19)爆发是2020年初全球报纸头条新闻。截至2020年2月28日,臭名昭著的病毒已经影响了84,124人,同时杀死了2,867人。该病毒的震中位于武汉市,位于中国大陆的湖北省。与非典疫情相比,这次中国确实做出了更快反应,以限制该病向其他地区的传播。但是,尽管尽了最大的努力,许多其他国家还是有许多疑似和确诊的病例。这篇博客文章将具体介绍该病毒的爆发。

免责声明:截至2020年2月28日,所有数据均为最新。

数据集

可以在Github上找到使用的数据集。它由约翰·霍普金斯大学系统科学与工程中心(CSSE)出版。数据每天更新两次。

https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19

探索性数据分析(EDA)

数据源具有三种类型的数据:“确认”,“死亡”和“已恢复”,可在三个单独的文件中使用。来看看它。

Structure

在观察数据结构时,发现它具有地理数据集的常见可疑对象(州,国家,纬度,经度)。每行的粒度仅在状态之前可用。在检查“状态”列时,看到它缺少值。对此进行调查。

看到,删除“州”列中的空值时,唯一国家/地区的数量存在差异。大多数州数据来自中国大陆,其次是美国。继续查看摘要统计信息。

统计摘要

这里没有太多惊喜。数据有4332行。一切似乎都非常简单。更深入地进行一些分析和可视化。

中国

知道冠状病毒的爆发起源于中国。因此这应该是首选。尝试看看中国的地区是如何受到影响的。

看到湖北地区显然是该病毒的最高感染者。如前所述,武汉市是湖北省的省会。难怪在湖北看到大量确诊病例。确切的数字是65,914。这尤其令人着迷,因为全世界已确认的病例总数为84,124。这意味着仅湖北地区就占确诊病例总数的78.35%!

尝试看看中国湖北以外的情况。

广东省确诊病例数最高,仅次于湖北省。其次是河南省(1272)。

从死亡和恢复图可以看出,河南地区的死亡和恢复数最大。谷歌的快速搜索显示,与广东相比,河南实际上更靠近湖北。也许,邻近性可能是导致这些高数量的因素?对这些假设进行统计检验会很有趣。也许会在以后的博客文章中重新讨论。

该图是中国冠状病毒病例的时间序列图。可以看到,在2月12日至2月13日之间,确诊病例的数量激增,随后斜坡变平。也许有关诊断和治疗的信息在这段时间有所改善?红色恢复线的斜率朝图的后半部变陡,表明恢复的病例数增加,这一事实得到了支持。�

将注意力从中国慢慢转移到世界其他地区。

韩国是中国境外确诊病例最多的国家。该国有2337例冠状病毒病例。

需要注意的一个非常有趣的数字是,在韩国之后,意大利的确诊病例最多,为888。几个小时前,收到消息称,由于应对这种病毒的努力,意大利大型足球比赛被推迟了。意大利米兰的一位传染病教授说,在检测到前几例之前,这种病毒可能已经在欧洲国家传播了数周。看来意大利可能还有很长的路要走。

看看在中国以外有多少宗致命的案件。

伊朗(34)紧随其后,意大利(21)则因中国境外的病毒而伤亡最多。根据中东国家的报道,一名伊朗国会议员死于该病毒。随后,许多国家决定禁止往返伊朗的航班。

尽管韩国是中国境外感染病例最多的国家,但该国的病毒死亡率仍然很低。

到目前为止,仅研究了全世界的死亡人数。看一下世界各国对抗这种病毒的情况。

可以看到,许多国家似乎从该病毒中获得了100%的康复率。乍看之下,越南,比利时,印度等似乎已对疫情表现出了惊人的反应。但是,百分比在很大程度上取决于分母,在这种情况下,分母恰好是确诊病例的数量。看看当我们筛选出具有最高复苏百分比的国家时会发生什么。

康复率达到100%的所有国家中,确诊病例数均少于20。相比之下,新加坡(93)和泰国(41)的病例数均显着增加。新加坡的康复率为68%,泰国为66%。亚洲两个邻国似乎在治疗该病毒方面做得非常好。好消息!��

现在,复制在世界其他地方用于中国的时间序列图。

可以看到,2月23日以后确诊病例的数量急剧增加。最近有新闻报道提到,全世界的病例数量迅速增加。

最后,这是一个动画的Geoplot,显示了病毒在世界范围内的传播。

https://chart-studio.plot.ly/create/?fid=Sayar1106:3#/

最初,仅在中国及周边地区看到斑点。在2月20日左右,欧洲的案件数量大幅增加。这与本博客文章中的上述观察结果一致。

结论

冠状病毒是当今媒体上最流行的话题之一。记者称这是致命的。由于担心爆发,全球市场损失了7万亿美元。流行病学家不确定该病毒的期限。

尽管本文提供了所有见解,但全世界可能仍有更多未发现的病例。

希望大家都喜欢这篇文章。所有图形均使用Plotly创建。Plotly是一个很棒的可视化库,用于构建交互式图。具有Python,R和JavaScript中的图形库。

帖子中使用的所有代码都可以在此处获得。

https://github.com/Sayar1106/COVID-19/blob/Notebook-Visualizer/Corona%20Virus%20Visualizer.ipynb

参考文献:

[1] https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6

[2]

https://www.kaggle.com/imdevskp/covid-19-analysis-viz-prediction-comparisons

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原始发表:2020-03-03,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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