如何用MEGA构建进化树

第一步：下载软件

虽说版本都更新到X了，但小编还是比较喜欢用MEGA7这个版本，从官网上下载即可。这个版本的界面是酱紫的。

第二步：整理FASTA格式的文件

序列比对

（1）打开MEGA软件。点击Align→Edit/Build Alignment→create a new alignment→OK→DNA/Protein；

（2）之后会弹出来这样的界面，点击左边红框里的按钮导入文件，全选之后点击右边序列对比快捷键，进行序列对比；

（3）所有的参数默认，进行序列比对；

（4）保存比对结果，保存为mas文件。

构建进化树

（1）点击Phylogeny按钮，一般常见的树有两种：Maximum Likehood Tree和Neighbor-Joining Tree，这里我们选择后者举例。导入比对好的序列会出现下图左边的两个图标。敲黑板下一步一定要设置的参数，选择Bootstrap，并设置为1000；

（2）运行，这个过程需要等待；

（3）大功告成，点击下面红框里面的按钮可以进行调整。

今天的这个技巧大家都get到了么？接下来会有更多内容发布，请持续关注我们！为我们点赞，我们需要Skr!!!