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annvar下载数据库的网址

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用户1680321
发布2020-04-25 13:12:50
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发布2020-04-25 13:12:50
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文章被收录于专栏:yw的数据分析yw的数据分析

背景

因为annovar默认的脚本下载数据库,总是中断,所以我选择用wget 下载

方法

比如想下载hg19_gwava数据,那么需要下载原始txt数据和idx文件,路径如下

http://www.openbioinformatics.org/annovar/download/hg19_gwava.txt.gz

http://www.openbioinformatics.org/annovar/download/hg19_gwava.txt.idx.gz

下载之后再解压就好了,像refGene(没有idx文件)这些都可以参照上面的下载下载

最后附上annovar可以下载的数据库的名称说明:https://annovar.readthedocs.io/en/latest/user-guide/download/

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原始发表:2020-04-24 ,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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