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Cancer-Mine: 基于文本挖掘的癌症数据库

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生信编程日常

发布于 2020-05-04 21:25:05

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发布于 2020-05-04 21:25:05

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文章被收录于专栏：生物信息学、python、R、linux 生物信息学、python、R、linux生物信息学、python、R、linux

CancerMine (http://bionlp.bcgsc.ca/cancermine/) 是一个基于文本挖掘的有关于驱动基因，致癌基因和抑癌基因数据库。2019年发表于Nature Methods上。

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可以直接查询某一个Gene在不同类型的癌症的分布情况：

查询某一种癌症中的基因情况：

提交一系列基因列表，查看与癌症的联系：

不同基因在不同类型的癌症中的重要性，越明亮越重要：

paper：https://www.nature.com/articles/s41592-019-0422-y

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