microRNA简介

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转录本的类型是多种多样的,除了编码蛋白的RNA外,还有很多非编码蛋白的RNA, noncoding RNA, 简称ncRNA。 在ncRNA中,根据长度又分成两类,长链非编码RNA, 指的是长度在200bp以上的非编码RNA, 缩写为lncRNA; 对于长度在50bp以下的RNA, 统称为small RNA。

small RNA包含了很多类型的小RNA, 比如miRNA, siRNA等,其中miRNA是研究的最为官方,最为成熟的小RNA。

miRNA是一类长度在18到36bp的非编码RNA, 关于miRNA长度的范围有很多说法,也有说是20到24bp之间的,大部分miRNA的长度在21或者22bp左右,miRNA的形成过程如下

首先由miRNA gene转录生成初级miRNA转录本,简称pri-miRNA, pri-miRNA的长度在300到10kbp之间,然后进一步加工生成带有茎环结构stem-loop的miRNA前体,简称pre-miRNA, pre-miRNA长度在70到90bp之间,最后在Dicer酶切作用下,从pre-miRNA的5’端和3’端分别剪切形成成熟的miRNA, 即mature miRNA, 所以一个pre-miRNA可能产生两个成熟的miRNA。

关于miRNA的作用机制,研究的也比较清楚。miRNA的功能属于转后后修饰调控,主要通过和mRNA的3’UTR区进行结合,结合区域称之为`seed`,当结合区域的序列完全配对时,诱导mRNA降解, 当只有部分序列配对时,抑制mRNA的翻译,从而发挥一个负调控的机制, 示意图如下

对于miRNA而言,除了研究其表达水平上的组织特异性,时间,空间特异性之外,miRNA靶标基因的研究也是重要的一环,由于miRNA研究起步早,研究热度高,有很多数据库可供参考,在后续文章中会详细介绍。

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本文分享自微信公众号 - 生信修炼手册(shengxinxiulian),作者:lzyg

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原始发表时间:2018-11-27

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