circos 可视化手册-connector 篇

connector 用于展示基因组上两个位置之间的关系，通过一套折线将两个位置连接起来，示例如下

靠近染色体的折线区域就是connector了。可以看到，connector也是通过一个圆环区域进行展示，连线的起始位置位于圆环的内径上，终止位置位于圆环的外径上。

配置文件的写法如下

首先看下file中定义的数据内容

在file中，，每一行定义了一条连线，第一列是染色体名称，第二列和第三列分别代表连线的起始位置和终止位置，起始点位于r0上，终止点位于r1上，示意图如下

connector的属性比较少，r0和r1定义圆环的内径和外径， 决定connector在图上的位置; thickness定义连线的粗细，color定义连线的颜色。

连线的形状由connetor_dim属性控制，这个数值的值是由5个数值构成的list, 用法如下

connector_dims = 0.05,0.15,0.6,0.1,0.1

这5个数值将r0和r1之间的距离划分成5个区域，数值代表的是每个区域的比例，所以5个数值的和一定为1，示意图如下：··

connector的用法相对简单，在实际使用中的频率并不高。