python读写压缩文件
对于很大的文本文件，通常会压缩之后再进行存储和传输，比如二代测序的fastsq文件，通常都是gzip压缩之后的格式。对于压缩文件的读写，通过python的内置模块也可以快速搞定。根据压缩格式的不同，提供了以下3个模块
1. gzip
gzip模块用于处理后缀为gz的压缩文件，读取gzip压缩文件的代码如下
>>> import gzip>>> with gzip.open('file.gz', 'rt') as f:... for line in f:... print(line)生成gzip压缩文件的代码如下
>>> with gzip.open('file.gz', 'wt') as f:... f.write('hello')2. bz2
bz2模块用于处理后缀为bz2的压缩文件，读取bz2压缩文件的代码如下
>>> import bz2>>> with bz2.open('file.bz2', 'rt') as f:... for line in f:... print(line)生成bz2压缩文件的代码如下
>>> with bz2.open('file.bz2', 'wt') as f:... f.write('hello')3. lzma
lzma模块用于处理后缀为xz的压缩文件，读取xz压缩文件的代码如下
>>> import lzma>>> with lzma.open('file.xz', 'rt') as f:... for line in f:... print(line)生成xz压缩文件的代码如下
>>> with xz.open('file.xz', 'wt') as f:... f.write('hello')对于压缩文件，选择压缩格式对应的模块来操作即可。
·end·
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原始发表：2020-05-11，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
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