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python3中的.maketrans()方法

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生信编程日常
发布2020-05-18 15:47:15
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发布2020-05-18 15:47:15
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Python3中字符串的.maketrans()方法可以用于创建字符映射转换表。 一般来说接受两个参数,第一个参数是字符串,表示需要转换的字符,第二个参数第转换的目标。两个字符串的长度必须相同,是一一对应的。比如:

代码语言:javascript
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# python3
rule = str.maketrans('abcd', '1234')
print('aaac'.translate(rule))

# python2
import string
rule = string.maketrans('abcd', '1234')
print('aaac'.translate(rule))

输出:1113

这里需要注意的是,在python2和3中用法并不完全相同,python2中需导入string模块。

一般常接触的.maketrans()方法是在”得到一段DNA序列的反向互补序列”的时候,如果不用.maketrans()的话写法会比较冗余。如果用的话会很简洁:

代码语言:javascript
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def trans_seq(sequence):
    rule = str.maketrans('ACGTacgt', 'TGCAtgca')    
    new_seq = sequence.translate(rule)     
    return new_seq[::-1]
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