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Ecography: 物种分布估计不准的原因

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Listenlii-生物信息知识分享
发布2020-06-01 12:29:28
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发布2020-06-01 12:29:28
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Journal: Ecography

First published: 01 June 2019

物种分布模型(Species distribution models, SDMS)广泛用于根据现有数据预测物种的分布。每天都有不止一项关于这一课题的研究发表。

然而SDM结果也受到了不少批评,主要原因有三个:

(1)物种共发生信息的偏差;

the effects of biases and the quality of occurrence information about species

(2)响应和预测变量相关的函数的相关特征;

the correlative character of the functions relating the response and predictor variables

(3)用于估计所得结果准确性的验证方法不一致。

The inconsistency of the validation methods used to estimate the accuracy of the obtained results

这些缺点与大多数SDM的两个基本特征有关:

一是缺乏关于物种分布的缺失信息;

the general lack of reliable absence information on the distribution of species

二是在建模过程中频繁使用任意地理范围划定特定区域

Frequent use of an arbitrary geographical extent (GE) in the processof model building

对于物种缺失数据的信息,是否想到了微生物研究中的“双零问题”

简言之,即:

(1)大多数生物体缺乏可靠的缺失数据;

(2)存在-缺失之间的关系是存在一定相关的;

(3)如果不事先了解物种的流行情况,就很难找到将SDMs提供的连续输出值转换成二进制的最佳方法。

而目前由于缺乏可靠的缺失数据,SDMs中经常会使用从研究区域中随机选择的伪缺失或背景缺失数据。

以上的问题促使作者建立了一种称为Niche of Occurrence(noo)的过程。NOO仅依赖于物种存在的部分信息,并可提供物种的可能分布。本文介绍了NOO的主要特点,并将其性能与已存在的、较为复杂的SDM进行了比较。这部分方法不再赘述。

Reference

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/ecog.04563

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原始发表:2019-07-09,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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