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SCREEN: 候选顺式调控元件

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生信编程日常
发布2020-06-02 15:35:44
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发布2020-06-02 15:35:44
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文章被收录于专栏:生物信息学、python、R、linux

SCREEN是一个可以搜寻和可视化候选顺式调控元件的网站。其中顺式作用元件是由ENCODE中的数据中得到的。在首页搜索框中可以根据位置、基因名字或者SNP ID的名字搜索。

搜索之后可以得到这样的结果:

除了cCREs和基因表达,还可以看到这个基因在多个tissue中的情况:

网站使用说明在tutorial这里:

并且还可以下载得到网站中的各种cCREs的数据:

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