今天和大家分享的是2020年3月发表在Journal of Cancer(IF:3.182)上的一篇文章,“The immune infiltration in clear cell Renal Cell Carcinoma and their clinical implications: A study based on TCGA and GEO databases”,作者使用GEO和TCGA数据集研究了肾透明细胞癌中免疫浸润细胞的情况,并与正常组织进行了对比,通过生存分析研究了其临床意义。
标题:The immune infiltration in clear cell Renal Cell Carcinoma and their clinical implications: A study based on TCGA and GEO databases肾透明细胞癌的免疫浸润及其临床意义:一项基于TCGA和GEO数据库的研究
一、 研究背景
肿瘤微环境由肿瘤细胞、各种免疫浸润细胞、成纤维细胞、许多细胞因子和催化因子组成,是一个动态平衡的复杂系统。免疫应答在肿瘤生长、侵袭和转移中起重要作用,因此肿瘤浸润免疫细胞(TIICs)可以成为化疗放射治疗的靶点。本篇文章中,作者用CIBERSORT网页工具研究了肾透明细胞癌(ccRCC)中的免疫浸润细胞及其临床意义。
二、 分析流程
三、 结果解读
图1.比较ccRCC和正常匹配组织中22种TIICs
图2.ccRCC中不同TIICs间相关性热图
图3.22种TIICs与预后的关系
图4.预后相关TIICs的的生存曲线
图5.免疫细胞与ccRCC Fuhrman分级的关系
小结
本篇文章中,作者利用CIBERSORT网页工具从ccRCC肿瘤转录组推测22种TIICs亚群的浸润比例,并结合预后结果来推测其临床意义。
以往研究表明,当肿瘤组织中存在功能成熟的DC时,CD8+T细胞与良好预后相关。本文中,ccRCC中CD8+T细胞浸润与不良预后相关,静息和激活DC与良好预后相关。这些结果共同表明,DC可能参与抑制T细胞,有望成为联合治疗的靶点。研究表明Treg和M2有促肿瘤作用,而本文中ccRCC CD8+T细胞,Treg,Tfh随着Fuhrman分级增加而增加,且CD8+T与M2间存在负相关,说明M2,Treg,Tfh可能在T细胞耗竭中起“检查与平衡”的作用。
局限性:
作者为了扩大样本量,结合了TCGA和GEO数据,但这样可能会影响结果的可重复性。其次,本篇文章结果是基于公共数据库和计算机算法完成的,因此结果的准确性仍需要进一步的实验来验证。