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​在 Pycharm中玩转 GitHub(图文详解)

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生信菜鸟团
发布2020-06-05 10:25:44
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发布2020-06-05 10:25:44
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一、Git 的诞生

1 Git 的诞生

说到 GitHub 就不得不提 Git,它的诞生也颇具传奇色彩。

在1991年,大佬 Linus 构建了开源操作系统,并命名为 Linux,随后带领全世界计算机爱好者逐渐完善该系统 。相对我们熟悉的Windows系统,这个名叫 Linux 的操作系统同样渗透到我们生活的方方面面,比如是大部分网站应用数据与服务的系统载体。包括手机的 Android 系统,车载系统,智能终端等等也是基于Linux内核完成。

Linux 在开发伊始,Linux 开源社区的人们通过将源代码文件通过 diff 的方式发送给 Linus 大佬,然后 Linus 使用多年的功力手工将这些代码整合到 Linus。但是,随着社区提供的代码越来越多,Linus 也扛不住了。

这时候,就需要一款工具可以将不同人,不同来源的代码整合到软件的主代码中。而且可以对源代码修改,删除等等改动一一记录,方便后续的调试和整合。这样做既可以提高工作效率,方便调试,同时也避免了人为错误导致软件的不稳定。总之,这款工具的使用对 Linux 的发展必不可少。

及时雨来自商业版本控制系统 BitKeeper,它向 Linus抛出了橄榄枝,允许 Linux 开发社区免费使用。但是,问题在于社区里都是计算机技术狂热者,这相当于给了饿了几天的人一个包子,说你不能吃肉馅,只能吃皮。于是,有人对这个控制系统产生了想法,Samba(Linux的文件共享和打印机通信协议)的开发者 Andrew 开始尝试破解 BitKeeper,尝尝肉馅是什么味。好景不长,BitKeeper 的开发公司 BitMover 发现了社区有人在破解他们的软件,而且还不止 Andrew 一人,于是公司看透了这群"绿林好汉",在2005年 BitKeeper 收回了 Linux 社区的免费使用权。

没有了免费的版本控制系统,日子还得过,Linux 的代码量还在与日俱增,Linux 社区要给商业软件低头了吗?

事实是,并没有。

2005 年,Linus 为了解决这一问题,他自己花了两周时间开发了一个分布式版本控制系统 Git,你没有看错是两周时间,大佬的世界我不懂。

一个月后,Git 完成 Linux 系统源码接管任务,随后 Git 迅速在开源社区间流行。

2 GitHub 的出生

Git 可以在本地执行,但是这只是你一个人在玩代码。如果你想通过 Git 分享你的代码或者与其他开发人员合作。你就需要将数据放到一台其他开发人员能够连接的服务器上。

2008年, GitHub 应运而生,它为每个人提供了远程仓库,并且提供了相应的社区化服务。

GitHub的上线为开源项目提供了立足之地,我们熟系的 JQuery,PHP 等开源项目开始从独立的社区迁移到 GitHub。而 正如 Apache 开源基金会所提倡的先社区而后代码,一个强有力的社区能使一款有潜力的软件持续的向好发展。

其实,我们现在看生信文献的时候,只有涉及到生信软件发布,数据流程处理,在线软件等等与编程相关的上线项目都会首先发布在GitHub,并提供 GitHub 克隆地址。

2018年,微软宣布以 75 亿美元收购 GitHub。

2019年,GitHub 宣布开发者可以免费最多四人协作的私人仓库。这一权限的开放,使得我们大部分的实验人员都可以更好的加入 GitHub 社区,完成多人协作任务。

历史的拐点就是这么神奇,如果没有 Andrew 的破解,BitKeeper的愤怒,Linus 也不会创造出 Git,也更不会有现在免费的 GitHub。

3 GitHub和Git 对我们来说有什么用?

从上面的故事可以看出,Git 和 GitHub 要解决的是多人协作完成不同地点,不同时间提交源码并整合到最终项目的问题。总结下:

  • 版本管理:通过使用快照等方式,可以将你的代码修改可以提交到 Git 库。只要提交,全部的数据就会被记录一个版本,而且Git很难执行不可逆操作,这就意味着只要提交,数据想丢都难。
  • 协同修改:多人并行不悖的修改服务器端的同一个文件,数据备份
  • 文件状态:不仅保存目录和文件的当前状态, 还能够保存每一个提交过的历史状态,很赞的功能就是,可以将历史代码回溯到某个时间点的状态。
  • 权限控制:团队中每个人对文件具有不同权限,也可以接受非团队合并源码
  • 分支管理:将不同来源,功能整合与主要代码中,允许开发团队在工作过程中多条生产线同时推进任务, 进一步提高效率
  • 分布式:同一个Git仓库,可以分布到不同的机器上,这就意味着代码可以在云端和本地都有一套完整的仓库,除了离线使用的便利,提高了执行速度,多个拷贝也提高了数据安全性。

接下来我们完成 Git,GitHub 在 Pycharm 的安装:

4 安装 Git

CentOS

代码语言:javascript
复制
  sudo yum install git-all
  git --version

Ubuntu

代码语言:javascript
复制
  sudo apt-get install git

Windows

https://git-scm.com/downloads

5 本地 Git 关联 GitHub 远程仓库

1.生成秘钥

代码语言:javascript
复制
  ssh-keygen -t rsa -C "XXXX@XXX.com"
  • 第一步确定秘钥生成目录,直接回车
  • 第二三步输入密码
  • 秘钥生成后,进入秘钥目录,比如我的为/c/Users/baimo/.ssh/id_rsa,复制备用

2.进入 GitHub https://www.github.com,打开设置

3.新建一个 SSH key

4.填写 SSH key

5.新建 GitHub 仓库

6.填写信息,创建 GitHub 仓库

7.完成后你的仓库后,类似这样,红框为 git 地址

8.将 GitHub 仓库与我们本地的 Git 仓库进行关联

代码语言:javascript
复制
  git remote add origin https://github.com/qqdb/example01.git

origin 后的 url 就是 GitHub 仓库地址,在上一步中获取

9.将本地 Git 仓库提交到 GitHub 远程仓库

第一次提交:

代码语言:javascript
复制
  git push -u origin master

之后提交

代码语言:javascript
复制
  git push origin master

如果报错:

解决:

代码语言:javascript
复制
  git push -f origin master

这是一种强制上传方案,第一次可以使用,今后不建议使用。因为这条命令会直接覆盖远程仓库的版本信息。

6 推送本地仓库到 GitHub

1.进入设置

2.登录 GitHub 账号

3.配置 Git

4.使用

5.配置

6.上传,这里一般会全部上传到GitHub,如果有大文件可以考虑取消勾选。

7.上传成功

7

将 GitHub 仓库克隆到本地

1.进入配置

2.克隆项目

克隆自己的项目

克隆大佬的项目

完成后会有读条

2.从 Pycharm 中查看 Github

3.一般的 Git 操作

8

参与 GitHub 项目

1.Fork 一个项目

Fork是GitHub存储库的副本,可在不影响原始项目的情况下更改代码。

比如,https://github.com/scikit-learn/scikit-learn

2.进入 Pycharm 的版本控制界面

3.克隆大佬项目

等进度条跑完

我们会得到项目的仓库

6.查看项目参与者的操作日志

7.项目参与者创建pull请求

填写pull请求

项目的维护者管理pull请求

查看pull请求信息

Git 和 GitHub 的使用方法远远不止这些,更多技巧稍后更新。

如果对 Pycharm 使用和数据分析感兴趣,也可以看看:

搭建 Python 高效开发环境:Pycharm + Anaconda

如何在 Pycharm 中高效使用 R 语言 (图文详解)

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原始发表:2020-06-03,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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