使用IBS绘制蛋白质或核苷酸序列

简介：生物序列图是可视化蛋白质或核苷酸序列中各种功能元件的基础。 在这里，我们介绍了一个称为IBS的软件包，该软件包可用于以方便和精确的方式表示蛋白质或核苷酸序列。 IBS中提供了多个选项，并且可以按照用户定义的模式对生物序列进行操作，重新着色或重新缩放。 而且，最终可以生成可作为文献发表的图片。

IBS（Illustrator for Biological Sequences）是一个专业的基因及蛋白序列图绘制软件，既可以画蛋白质序列，也可以画可视化核酸序列，同时还拥有多种模板与推荐配色。该软件的制作团队为华中科技大学薛宇教授的团队，如果大家发文章使用了这个软件，请记得引用他们的文章。

第一步：首先查找相关基因或者蛋白质的序列结构，这里我用的是ERBB2蛋白结构域信息。

第二步：下载和安装IBS软件，根据自己电脑的系统下载。（http://ibs.biocuckoo.org/download.php）

第三步：打开软件，在左上角新建一个新的project。首先根据上面得到的信息，绘制序列长度即可。

第四步：新增一个结构域，设置其起始点，颜色等信息。

第五步：依照ERBB2的示例，我们新增一个文字Note，设置文字内容，字体大小等信息，文字位置等信息。

第六步：依照ERBB2的示例，我们新增一个圆形Site信息，设置Site位置，颜色等信息。

最终得到如下的图片

第七步。左上方export image as可将图片保存