6月数据库汇总 （截止6.21）（上）

写在前面

整个5-6月份发表了近100篇数据库文章，去掉一些其他物种的以及植物方面的数据库，最后剩下了一下这些数据库。(数据库检索方式主要还是基于我们之前发表的数据库的脚本，可能会有一些遗漏)。

这次的数据库我们分成了六个方面。(1) 疾病相关数据库；(2) DNA相关数据库；(3) RNA相关数据库；(4) 蛋白相关数据库；(5) 组学分析流程数据库；(6) 微生物和老鼠相关数据库；(7) 其他数据库。

由于这个月发表的数据库比较多，所以我们分上、中、下来介绍这些新发表的数据库。这次我们介绍疾病相关数据库，DNA相关数据库以及其他物种的数据库。

以下是所有这个月数据库的汇总，如果想要pdf格式的文件。可以直接后台回复:"2006"。

PART 1

疾病相关数据库

这类疾病相关的数据库，基本上是总结了多个公共数据集的数据集来进行分析。通过这样的数据库，我们就省去了去GEO这样的公共数据库检索目标疾病数据集的时间。

1. SNE-NICHD https://snengs.nichd.nih.gov

视网膜数据库：提供了多个物种关于视网膜和松果体的转录组数据。

2. OSluca http://bioinfo.henu.edu.cn/Index.html

肺癌生存分析数据库：数据库纳入了35个数据集的5741个患者的生存数据。不过只是一个简单的各个数据集的汇总做完的汇总。并不是整合到一起的结果。

3. dBMHCC http://predictor.nchu.edu.tw/dBMHCC/index.php

肝癌标志物数据库：整合了多个数据库，可以检索基因是否为肝癌的标志物。

4. VIRdb https://www.vitiligoinfores.com/index.html

白癜风综合性数据库：利用白癜风相关的高通量数据分析和白癜风相关的基因。

5. MyomiRDB http://www.myomirdb.in/

肌肉萎缩相关miRNA数据库：分析肌肉萎缩过程当中相关的miRNA以及这些miRNA相关功能的数据库。

6. TTRMDb http://vit.ac.in/ttrmdb

甲状腺素蛋白突变体的淀粉样疾病数据库。

PART 2

DNA相关数据库

1. SNPnexus https://www.snp-nexus.org

SNP注释数据库：对SNP位置和调控相关预测数据库。

2. EpiRegioDB https://epiregio.de/

非编码DNA区域对于基因表达调控数据库：通过输入基因名来获取这个基因可能受到的调控位置，属于预测表观遗传的数据库。

PART 3

老鼠和微生物数据库

1. PROSPECT http://PROSPECT.erc.monash.edu/

细菌蛋白质磷酸化位点预测数据库：通过输入 fa序列来进行预测。

2. PSI-MOUSE http://psimouse.rnamd.com

老鼠的假性尿苷（Ψ）数据库

3. gutMEGA http://gutmega.omicsbio.info

人类肠道基因组图谱数据库：收集了多个16S测序的结果来综合的一个数据库，是肠道基因组方面一个很好的数据库了。