作者:科研猫 | 流星石
责编:科研猫 | 依米
在撰写文献的过程中,我们往往发现,一幅简洁、准确的图画通常会比单纯的文字描述更加直观易懂。然而,想要绘制一幅图却总是对传统绘图软件繁琐复杂的步骤感到头痛,毕竟像PowerPoint、Illustrator、Photoshop这些传统绘图软件并非只是为了制作生物序列图而准备。
今天给大家安利一个绘制图神器IBS,它或许可以帮助你分分钟完成图形的绘制,不用煞费苦心就能得到美观的绘图成果。
IBS简介
IBS是一款专业的核酸和蛋白质生物序列图绘制软件,为华中科技大学薛宇教授的团队CUCKOO制作,内置蛋白质序列和核酸序列的多种模板和推荐配色,也可以自己进行创作。
IBS可以下载使用也可以在线使用。下载使用功能与在线版差别不大。两者的区别是:下载版有35个蛋白样品图和27个核酸样品图,在线版只有20个蛋白样品图和20个核酸样品图。
IBS软件下载
输入网址:http://ibs.biocuckoo.org/,点击DOWNLOAD下载。
根据需求选择Windows或者Mac等版本。如果不是JAVA的运行环境,需要先安装运行JAVA( https://www.java.com/ )
IBS绘制步骤
由于下载版使用功能与在线版差别不大,本文仅提供在线版绘图步骤。
01
查找序列结构
Ensembl:
http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Info/Index
NCBI:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Uniprot:
https://www.uniprot.org/
02
绘制图形
首先登录IBS网站:
http://ibs.biocuckoo.org/
在线绘制图形,有三种绘制方法:1、自定义画图;2、模板上修改;3、输入蛋白质ID生成图。
1、自定义画图。进入网站后,点击WEB SERVER在线操作,点击新建画布
,按照绘制需求设置参数。
2、模板上修改。进入网站后,点击WEB SERVER在线操作,从Demo里找到需要的模板,直接在模板的基础上修改。
选中单个元素后右键,出现功能按钮。功能对照如下:
Edit:编辑元素的颜色、形状、纹理等;Add:添加元素;Duplicate:重复添加选中的元素;Delete:删除;Move:移动;Zoom In:放大画布;Zoom out:缩小画布;save:保存。
3、输入蛋白质ID。在网站首页点击FOR DATABASE,可以直接搜索蛋白质的ID进行绘图。
03
观看视频学习
如果想了解更加详细的图画绘制步骤可以观看网站发布的教学视频学习。点击USER GUIDE,可以观看教学视频。
最后,由于网站和软件都是可以免费使用的,为了表示对创作者的尊重,我们在使用IBS制图撰写文献时记得引用参考的文章。网站首页点击CITATION,里面有很多可以参考的文献。
今天的分享就到这里,期待大家使用IBS制作的精美示意图。