Image Pro Plus分析面积、面积比。
“ 一文讲清楚IPP测量面积、面积比。”
很多小伙伴辛辛苦苦做病理实验，采集图像，但是到了分析图像时就卡壳了。
充分利用Image Pro Plus（简称IPP），将帮助我们获得更多客观的数据，既增强了说服力，也充实了文章数据体量。
本期，小编打算讲一讲IPP测量图片中目标元素的面积或面积比。
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重要概念
1、什么是AOI？
AOI全称“area of interest”，即你感兴趣的区域。IPP是一款软件，它无法知道我们到底要测量图中的什么元素。因此，我们必须人为设定图片中需要测量的元素，IPP才能准确分析。如此，可以将问题分为两个。
第一，所测图片中布满了你需要分析的元素，几乎没有其它干扰或空白。此时，不用再选择AOI，默认整张图片就是你感兴趣的、需要测量的元素。
如下图（图为心肌梗死后心肌纤维化，Masson染色），图中充满心肌和胶原，仅有非常小的空隙，此时若分析“胶原比例”这一数据，则整张图就是AOI。这也提示我们，如果分析这样的图片，在采集图像时我们需尽量避开空白区和干扰区，否则会影响测量结果。
第二，所测量的元素仅占图片一部分，其它位置为空白或者你并不想测量。此时，必须在IPP上手动圈出AOI，然后才能进行分析AOI中的元素。
如下图（图为心梗后心脏横断面，Masson染色）。很明显，图中存在大量的空白区域，分布于心脏之外和心腔。此时若要分析图中心肌组织，则必须要设定AOI。血管、空腔脏器等以此类推。
2、什么是面积和面积比？
每一张图像，都是由非常多的像素方块组成。图中某个元素的面积是组成该元素的像素数与单个像素的面积，在IPP中测量指标为“Area”。同一倍数下采集的图片像素面积是一定的，因此可以将面积比较简化为像素数量的比较，最终用像素数量代替也是可以的。同理，图中不同元素之间的面积比也是其像素数量之比，在IPP中测量指标是“Per Area (Object/Total)”。
综上可以看出，正确的选定AOI是大前提，也是最重要的。测量指标是机械的。下面，小编就以测量胶原容积分数为例，将2种情况详细说明。
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全图为AOI
步骤：
（1）打开IPP软件，点击file-open，打开一张你要测量的图片。点击count and measure object。
（2）在弹出的方框中选择如下，进入测量指标界面。
（3）在弹出的方框左侧点击面积、面积比。点击OK。
（4）选择Munual手动，选择Select color。
（5）如果你的图像染色对比度高，则在color cube based模式下，选择箭头指示的吸管工具。然后多次点击图像中的不同位置的蓝色胶原，直到将所有的胶原标记为红色。点错了就选吸管工具旁边的返回键按钮或消除所有标记按钮。这种模式即RGB模式，适合心灵手巧染色好的朋友使用。
（6）如果你的图像染色对比度较低，不同颜色之间区分度不高，则在Histogram Based模式下（一定要将右侧圆框中修改为HSI），左右拖动箭头所指的竖线，直到将所有的胶原标记为红色。目的都是一样的，只是选色方式不同而已。HSI模式更符合实际，毕竟实验不好做嘛......逃。
（7）标记好之后，点击close。点击count，见图中出现绿色数值。进一步点击View中的statistics，弹出的方框即时测量结果。结果看Sum值，可得出图片胶原比例为0.423179。
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部分元素为AOI
有了上面的基础，这一部分小编就只重点说如何选择AOI，后面的测量步骤不再赘述，操作完全一样。
步骤：
（1）打开IPP软件，点击file-open，打开一张你要测量的图片。点击箭头指示的Irregualr AOI（我们要感兴趣的区域大多不规则），弹出下面的长条框，这种模式是手动勾勒AOI。
（2）第一次，勾勒心脏外轮廓。单击左键，慢慢勾勒图中心脏轮廓（超实用技巧就是双击左键，IPP会自动勾勒一部分的轮廓，比咱们勾勒的更精确），勾勒结束后单击右键，轮廓线变成绿色。
（3）第二次，勾勒心腔轮廓。先点击箭头所指的multiple AOI，点击Add，点击NEW AOI按钮，新建一个AOI工具。
（4）第二次，勾勒心腔轮廓。操作方法同上，得到下图的效果。
（5）接下来，完全参照小编在第二部分的操作步骤。标记图中蓝色的胶原，并设定检测指标，如面积Area、面积比Per Area (Object/Total)，分析、并输出相应的检测结果。
总结：
IPP分析图像面积、面积比的详细步骤基本结束，小编认为基本可以适用于大多数场景了，也是没有问题的。此外，还有一些非常细节的内容，可以一定程度地提高分析的精准度，例如如何过滤元素中的小孔洞、如何过滤杂点的影响等等，小编今后再详细说明，避免与本期内容混杂。
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完结，撒花！
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