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如何采用Image Pro Plus测量病变区域的总面积?

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Mark Chen
发布2020-07-20 16:56:06
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发布2020-07-20 16:56:06
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文章被收录于专栏:聊点学术聊点学术

前言

常规的组织切片病理变化评价,多采用4级法(即轻微、轻度、中度、中度)。这是一种经典的组织病变评价方法,也是当前的主流。

但随着全切片扫描和量化分析观念的普及,定量分析组织病变逐渐流行。

有时,定量分析后获取数据,能够较准确地反映病变的实际程度和病变范围。当然了,获取的这些数据也更方便对组间差异进行统计学分析。进行统计分析的一个较大前提是在可能的范围内扩大实验样本量,这样分析出来的数据才可能通过统计学的检验,并且真实地反映病变程度。如果样本量太小,获得的定量数据可能会影响判断。

不论如何,转变观念,尝试定量分析,讨论和确定哪些类型的指标可以定量分析,可能是病理领域需要关注的地方。

闲话不多说,今天再来说说如何使用Image Pro Plus测量图片中不同目标区域的总面积。


步骤

1. 确定是否使用面积作为定量分析指标

面积测量是定量分析时的一个重要指标。

虽然切片上的病变看起来是二维的,但实际上病变可能是一个不规则立体的状态。因此,某些时候,切片上的面积所代表的实际意义可能比单纯意义上的长、宽、高、厚等更加具有测量价值。

一旦我们选择了使用面积来定量分析组织病变的程度,接下来就是分析确定IPP的测量模式。

2. 确定IPP的分析模式

IPP测量不规则区域的总面积常分为2种方法,即色彩自动选择模式和手动勾勒模式。色彩自动选择模式即是在吸管模式或HSI模式下,自动选定和计算图中所有的你确认的颜色所存在的区域,测量时不会受到组织分布复杂性的影响。手动勾勒即是通过手动的方法勾勒出目标区域,测量时不易受到病变在图中对比度弱的影响。这两种方法有各自适用的情况,不存在哪个方法更好。

组织病变的分布特征和切片染色方法都能决定IPP的测量方法差异。

为什么这样说呢?举个例子,可以看看下面两张图,分别为Masson染色和HE染色。Masson染色的目的是为了测算胶原组织面积,HE染色是为了测量肉芽组织面积。

对于Masson染色的图片而言,红蓝对比度极高,只需要准确识别蓝色区域的颜色,即可得到胶原的面积,并不用通过勾勒其轮廓。必须选择色彩自动选择模式。(关于这种模式的测量方法,往期内容已讲过 → Image Pro Plus分析面积、面积比。)

另一方面,HE染色图片的肉芽组织颜色无法与周围组织完全区分开,此时显然无法通过色彩自动选择模式来测量肉芽组织面积(吃力不讨好),应该采用手动勾勒模式。

3. IPP测量多个不连续目标区域总面积的图文步骤

示意图片需要测量肉芽组织的总面积(如下)。可见图中的肉芽组织分布并不连续,这种情况下需要通过3次手动勾勒才能将所有肉芽组织标记出来。

(1)常规打开IPP,点击open打开需要分析的图片,点击非规则区圈选按钮(即Irregular AOI)

(2)按住鼠标左键,完全勾勒出第一个目标区域的轮廓后,按鼠标右键结束

(3)接下来,先点击Multiple AOI,点击Add,再点击NEW AOI

(4)常按照步骤(1)的方法继续勾勒出第二个目标区域

(5)按照步骤(3),添加非规则区按钮,继续按照步骤(1)的方法勾勒第三个目标区域

(6)点击count and measure objects

(7)点击Edit中的Cover AOI To Objects,将图中勾勒的区域全部覆盖为红色

(8)若图中勾勒的区域未能全部覆盖为红色,存在孔洞。此时可点击count and measure objects中的Option选项,在弹出框中如下勾选

(9)点击count and measure objects中的View,点击Statistics查看Sum值,即所勾勒的3个目标区域总面积。单位为平方像素,若转化为实际尺寸需根据图中比例尺来确定。

结束

总结:使用IPP作任何测量之前,一定要思考这个预测量指标所代表的实际意义。IPP是软件,它只会根据人的操作输出结果,但解读这些结果所包含的实际意义则是更加重要的。

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原始发表:2020-04-09,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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