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网络药理学网站大全

网络药理学是发展创新药物的重要途径。

网络药理学是基于系统生物学理论而产生的一门新学科。

近年来,特别流行通过网络药理学进行药物的靶点预测,进一步实验验证,一定程度上简化了“盲人摸象式”的前期研究,也增强了最终确定的靶点可信度。即所谓的“干实验+湿实验”。

网络药理学的研究过程需要接触大量的数据库和专业网站,这是保证靶点预测准确度的前提,也是网络药理学的基本功。

因此,如果你想要做网络药理学相关的研究或分析,那么以下网站你必须得熟练查阅。

这里有一个汇总,供参考。


网站名字

网站地址

TTD

https://db.idrblab.org/ttd/

Drugbank

https://www.drugbank.ca/

DisGeNET

http://www.disgenet.org/web/DisGeNET/menu/home

OMIM

http://www.omim.org/

KEGG

http://www.kegg.jp/

PharmGkb

https://www.pharmgkb.org/

GAD

https://geneticassociationdb.nih.gov/

HAGR

http://genomics.senescence.info/

T-HOD

http://bws.iis.sinica.edu.tw/THOD

CardioGenBase

http://www.CardioGenBase.com/

arrhythmia database

http://www.fsm.it/cardmoc/

OncoDB.HCC

http://oncodb.hcc.ibms.sinica.edu.tw/index.htm

Liverome

http://liverome.kobic.re.kr/index.php

Uniprot

http://www.uniprot.org/

DAVID

https://david.ncifcrf.gov/

STRING

https://string-db.org/

BioGRID

https://thebiogrid.org/

IntAct

https://www.ebi.ac.uk/intact/

HPRD

http://www.hprd.org/

GENEMANIA

http://genemania.org/

TCMSP

http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php

TCMID

http://www.megabionet.org/tcmid/

TCM Database@Taiwan

http://tcm.cmu.edu.tw/

TCMGeneDIT

http://tcm.lifescience.ntu.edu.tw/

BATMAN-TCM

http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/

TCM-PTD

http://tcm.zju.edu.cn/ptd/

TCM-MESH

http://mesh.tcm.microbioinformatics.org/

PubChem

https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

HIT

http://lifecenter.sgst.cn/hit/

Binding DB

http://www.bindingdb.org/bind/index.jsp

ChemBank

http://chembank.broadinstitute.org/

ChemMapper

http://lilab.ecust.edu.cn/chemmapper/

ALOGPS2.1

http://www.vcclab.org/lab/alogps/

SwissTargetPrediction

http://www.swisstargetprediction.ch/

PharmMapper

http://lilab.ecust.edu.cn/pharmmapper/index.php

SEA

http://sea.bkslab.org/

STITCH

http://stitch.embl.de/

PASS

http://www.pharmaexpert.ru/PASSOnline/

SuperPred

http://prediction.charite.de/

DRAR-CPI

http://cpi.bio-x.cn/drar/?page=home

Cytoscape

http://www.cytoscape.org/

COXPRESdb

http://coxpresdb.jp/

MetaboAnalyst

http://www.metaboanalyst.ca/

DAVID

https://david.ncifcrf.gov/

Metascape

http://metascape.org/

GEO

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

CMAP

https://portals.broadinstitute.org/cmap/

affymetrix

https://www.affymetrix.com/analysis/netaffx/batch_query.affx?netaffx=netaffx4_annot

Venny2.1

http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

Venn diagram

http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

E Chart

http://www.ehbio.com/ImageGP/

注:以上网站大多属于国外运营,有时会打不开,并不是网址有误。这种情况也是做网络药理学分析时最不愿意看到的。所以有点子了,就赶紧检索并即时备注检索时间和存储数据,别无他法。

The end.

本文分享自微信公众号 - 聊点学术(SingForScience),作者:Mark

原文出处及转载信息见文内详细说明,如有侵权,请联系 yunjia_community@tencent.com 删除。

原始发表时间:2019-11-17

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