Development and validation of a nomogram with an autophagy-related gene signature for predicting survival in patients with glioblastoma
用于胶质母细胞瘤患者生存预测的自噬相关基因特征的列线图开发和验证
图1. DE-ATG的筛选和GO、KEGG分析
图2. 预后相关ATG的筛选与验证
图3. 将TCGA队列与CGGA队列分成高、低风险组
图4. 验证ATG的预后风险评分模型
表2. 单变量cox分析和多变量cox分析
图5. GSEA分析
图6. 构建与验证列线图
小结
最后小结一下,作者使用TCGA-GBM数据集筛选出差异表达的自噬相关基因(DE-ATG)。对DE-ATG进行单因素和多因素Cox回归分析,以鉴定与预后相关的基因:NRG1、ITGA3和MAP1LC3A,进一步构建预后风险评分模型,并使用生存曲线和AUC曲线证明了该模型的预测预后的能力,然后还通过2个CGGA队列进行验证。随后,作者使用GSEA分析上述三个基因,并发现高表达组主要富集于癌症和自噬相关的KEGG通路。最后,作者构建了涵盖自噬、年龄、药物治疗、放疗和IDH突变状态在内的预后列线图,并且基于TCGA / CGGA的校准图验证了其预测性能。